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填补Qiagen空白的植物RNA提取试剂盒包括多糖多酚困难样品.PDF

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填补Qiagen空白的植物RNA提取试剂盒包括多糖多酚困难样品

中国试剂网 8 填补Qiagen 空白的植物RNA 提取试剂盒 (包括多糖多酚困难样品) 填补Qiagen 空白、不用DNA 酶消化的植物RNA 提取试剂盒 一般公司多糖多酚植物RNA 提取试剂盒失败原因和解决方案 很多植物RNA 的样品由于含有大量的多糖、多酚、代谢产物、色素等成分,造 成RNA 提取过程中氧化、褐化、降解、由于植物品种的多样性造成情况更加复 杂。手工的CTAB 类的方法提取因为时间太长,太繁琐,手工方法不在讨论之列。 一直以来没有一款好的试剂盒包括qiagen、promega 等进口试剂盒也无法满足科 研工作者对植物RNA 提取的要求。 下面我们来分析一下植物RNA 为什么不能提取成功的原因: 市面上最常见的RNA 提取试剂盒无非是两种:第一种:TRIzol 改良类方法 (包 括溶液型的和离心柱型的)、第二种:直接裂解过柱子的方法 (离心柱) 第一种试剂盒失败的原因 1:RNA 市面上面最流行的方法就是 TRIzol ,或者 TRIzol 改良,或者TRIzol 加离心柱一类的改良方法。TRIzol 也就是异硫*酸胍/ 苯酚/氯仿原理一步法的方法最适合的对象是动物源性的组织细胞,针对普通多 糖多酚低的植物性的材料,TRIzol 类原理产品也可以提取。但是多糖、多酚、次 级代谢产物丰富的情况下,TRIzol 类方法无法防止多糖多酚对于 RNA/DNA 分 相的干扰,要么残留大量 DNA ,要么残留大量多糖、多酚或者次级代谢产物, 氧化破坏 RNA ,或者残留这些多糖多酚,色素代谢产物等抑制下游的反转录等 反应。限于技术水平的限制,市面上绝大多数的国产厂家是使用TRIzol 的方法 进行改良,无论是不是加了离心柱。但是实践证明,改良不能从根本上解决问题。 判断是否试剂盒使用这种改良的方法非常简单:是否裂解液含有苯酚的味道和使 用氯仿,如果使用到了氯仿就是TRIzol 方法的改良。 中国试剂网 8 第二种试剂盒失败的原因:直接裂解过柱子的方法是目前最先进的方法,但是也 是技术含量最高的方法。这个方法采用裂解液 (不含苯酚,氯仿)直接裂解, RNA/DNA 同时过柱子,然后在柱子上面直接分离RNA/DNA ,所以,这种方法 的优点第一在于,避免了使用trizol 在多糖多酚下不能成功分离RNA/DNA 的弊 端、第二在于,不使用有毒的苯酚氯仿。但是正是因为其技术先进,所以难度很 高,国内厂家包括进口公司有两个技术难点一直没有突破。第一,裂解液的成分 必须针对去除多糖多酚进行研发添加去多糖多酚,代谢产物成分。否则会同样碰 到多糖多酚干扰提取的问题。第二、和TRIzol 原理不同,直接过柱法DNA/RNA 同时加到吸附柱上去。如何去除DNA 是第一个难点。否则会残留大量DNA 。两 个技术难点的没有掌握导致了国内公司包括的第二种试剂盒失败。国外公司因为 没有掌握第一难点,裂解液里面没有去除多糖多酚成分,所以包括 Qiagen 的 RNeasy plant mini kit 盒子也常常不能成功提取较复杂植物RNA 样品如黑加仑、 冬青等植物样品。 北京艾德莱生物的研发人员经过 3 年的不断研发改良,针对多糖多酚植物的特 点,和这两种试剂盒失败的原因,开发出了世界领先水平的RN09 EASYspin 植 物RNA 快速提取试剂盒,第一:采用直接过柱子方法,彻底抛弃了TRIzol 苯酚, 氯仿原理方法,使用无毒原料,并且添加了有自主知识产权的去除多糖多酚成分 解决了多糖多酚和代谢产物对于RNA 的破坏和干扰分离。第二:突破了直接过 柱子的方法DNA 去除的技术难点,解决了DNA 残留过多问题。经过实践过程 中,几十种国内外试剂盒包括Qiagen

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