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桉树ESTCAPS标记的开发及其用于遗传图谱构建的研究
福矬农林人学2006届戗h生论土
桉树EST-CAPS标记的开发及其用于遗传图谱构建的研究
摘要
遗传图谱构建是当前植物遗传研究的热点,但林术遗传图谱构建中存在密度较低、共显性标
记不多、基于功能基因的标记缺乏等问题,如何开发共显性的、基于功能基因的分子标记并
用于林木遗传图谱构建是急需解决的问题。按树在全球范围内是重要的造林树种,也是林木
遗传研究的模式树种,其遗传图谱构建具有重要的理论意义和应用价值。
利用从GcneBank下载的细叶桉54条EST序列,进行了引物设计和PCR扩增条件优化,有
35对引物能成功进行PCR扩增。利用30种限制性内切酶对可成功PCR扩增的35个EST序
列在尾叶桉×细叶按F。作图谱系的多态性进行了筛选,分析了EST-CAPS标记的分离方式,
并将多态性的EST-CAPS标记整台到尾叶桉和细叶桉的RAPD遗传图谱上。
分离方式研究中,有7个EST序列可月;f合适的限制性内切酶酶切并在作图谱系中产生多态性,
种可靠的遗传标记,可用于桉属树种遗传图谱构建和相关研究。
在分离方式研究的基础上进行了遗传图谱构建的研究,运用作图软件Mapmaker3.0将
群.基于RAPD.CAPS的尾叶桉新图谱包含24个连锁群.新增连锁群1个,总遗传图距
1546.IcM.标记问的平均距离为10.8cM。另有1个偏分离标记未能连锁到任何连锁群上。整
合4个EST-CAPS标记后的细叶桉新图谱总遗传图距1122.5cM,分布于23个连锁群上.标
记间的平均距离为10.2eM。4个标记分布于第6、7、8和第10连锁群上。基于RAPDcAPS
的尾叶桉和细叶桉新图谱,遗传总图距分别增加了41.5cM和87cM:各自疆盖原来估计基因
组全长的97.5%和74.5%。因此,EST-CAPS标记技术可有效用于遗传图谱的构建,可以为桉
树及其它树种提供研究参考。
关键词:EST-CAPS:分离方式;桉属;遗传连锁图谱
主题词:桉属;EST-CAPS;遗传连锁图谱
桉树Es■CAPS标记的开发驶其用于遗传幽谱构建的础究
of
EST-CAPSmarkersandtheir to
Development applicationlinkagemap
constructionin
Eucalyptus
Abstract
Some stillexistinforesttree aslow small
problems linkagemapconstruction,suchdensity,a
numberofco-dominantmarkers few
used,and markers
gene-basedincluded,thoughlinkage
hasbeenahot in studies.Solutiontothese was
mapping topicplantgenetics problemsvery
inbotlltheoreticaland terms a crucialrolein
important applicationalEucalyptsplays global
andserveasamodelinforesttree constructionbe
forestry genetics;theirlinkagemap would
valuableanduseful.
considerably
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