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2011基因克隆的方法和原理

第十九章 基因操作 Chapter 19 Gene Manipulation 第三节 基因的克隆 Section 3 Gene Cloning 一、基因克隆中的工具酶 限制性核酸内切酶分类 限制酶的命名 EcoRⅠ E 代表Escherichia属 co 代表coli 种 R 代表RY13株 I 代表该菌株中分离的第1个限制酶 II类限制酶的底物识别顺序及切割位点 识别顺序 绝大多数的II类限制性内切酶在底物DNA上的识别 顺序为4~8个核苷酸回文序列(Palindromic) Hare III 5’-GGCC- 3’ BamH I 5’-GGATCC-3’ 3’-CCGG- 5’ 3’-CCTAGG- 5’ “怪才”李南阳的回文诗 转化 感受态细菌主动或被动摄取外源DNA的过程 热激法是最常用的转化方法 CaCl2处理,增加细胞壁通透性(0-50C) ,得感受态细菌 420C将细菌与重组的质粒DNA温育 第四节 克隆基因的表达 Section 4 Gene Expression pBV220、pET等,商品化供应 结构特点: 携带克隆基因的表达载体,在原核生物中表达所必备的表达调控序列: 启动子 终止子 核糖体结合位点RBS(SD序列) 其他调控序列 表达质粒载体pET的结构 原核细胞表达系统的优缺点 优点: 表达系统简单,容易操作 成本低,易于大量生产 生长周期短 缺点: 需要翻译后修饰的蛋白,不能用此表达系统 二、真核细胞表达载体 质粒载体和病毒载体 调控表达元件最初多来源于病毒 将重组真核载体导入真核细胞的过程称为基因转染 真核细胞表达系统的优缺点 优点: 可表达需要翻译后修饰的蛋白(糖基化修饰) 高雪病(葡糖脑苷脂沉积病):缺乏β-葡萄糖脑苷脂酶 ,吞噬糖脂的巨噬细胞使肝脾肿大 缺点: 表达系统相对复杂 成本高 生长周期长 第五节 基因结构的分析及改造 Section 5 Gene Structure Analysis and Modification 质粒DNA的分子构型和电泳模式图 松弛开环线性的L构型 松弛半开环的OC构型 超螺旋的SC构型 L SC OC Characters of plasmid vector: 复制子:能在宿主细胞内携带目的基因扩增 筛选标志:如抗药基因等(Ampr, Lac Z) 限制性内切酶位点和多克隆位点(MCS) 调控序列:表达载体必备 质粒可容纳10kb的外源DNA片段 三、基因克隆的必要条件 目的基因:原核、真核基因… 克隆载体:质粒、病毒载体… 工具酶类:内切酶、连接酶… 宿主细胞:细菌、动物细胞… 四、基因克隆的基本步骤 ① 酶切:制备目的基因和载体 ② 连接:目的基因和载体的连接 ③ 转化:重组的DNA导入受体细胞 ④ 筛选:DNA重组体的筛选和鉴定 基因克隆步骤:切、接、转、筛 (1)目的基因的获得 PCR、RT-PCR、基因组或cDNA文库、人工合成 (2)载体的选择 (3)目的基因与载体的连接 粘性末端、人工接头、同聚体尾、平端连接 粘性末端连接 阻止载体自连 定向克隆 人工接头--Linker 人工接头--Adaptor 同聚体加尾 平端连接 (4) 重组DNA导入宿主细胞 转化(transformation) 转导(infection) 转染(transfection) 热激法转化感受态的过程(play) (5) 重组DNA的筛选鉴定 遗传学方法:抗生素、蓝白斑筛选 核酸杂交法 菌落PCR法 免疫学方法 双抗生素筛选: PLAY Blue-White Screening: α互补:载体具有lacZ的调控序列和氨基端编码区,宿主 细胞具有lacZ的羧基端编码区 IPTG存在时β-半乳糖苷酶将底物X-Gal转化为蓝色产物, 得到蓝色菌落 载体的多克隆区域,克隆上插入片段导致α-肽编码区的 破坏,使β-半乳糖苷酶失活,得到白色菌落 表达系统: 原核细胞表达系统: 大肠杆菌 真核细胞表达系统: 酵母、昆虫、中国仓鼠卵巢细胞(Chinese Ha

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