MS计算所需要的文件的探讨.docVIP

MS计算所需要的文件的探讨（1） 一、 MS运行需要哪些文件 在ms模块中搭建好所需要的的结构，然后点一个模块比如castep下拉菜单中的“calcualtion”，出现一个菜单，在该菜单最下方出现三个选项，run，files，help，我们选择点击“files”，然后点击“save files”。这个时候你建立的结构就会默认保存在项目下。你将会发现项目下有很多文件（到工具栏下设置下显示隐藏的文件）。 1. 结构优化 将会在目录中发现如下文件：非隐藏文件（*.param,*.xsd, SMCastep_Extension_*.xms）,隐藏文件（*.cell,*.kpaux,*.trjaux）。 1)*.param文件： comment : CASTEP calculation from Materials Studio task : GeometryOptimization xc_functional : PBE spin_polarized : false opt_strategy : Speed page_wvfns : 0 cut_off_energy : 550.000000000000000 grid_scale : 1.500000000000000 finite_basis_corr : 2 finite_basis_npoints : 3 elec_energy_tol : 5.000000000000000e-007 max_scf_cycles : 100 fix_occupancy : true metals_method : dm mixing_scheme : Pulay mix_charge_amp : 0.500000000000000 mix_charge_gmax : 1.500000000000000 mix_history_length : 20 nextra_bands : 0 geom_energy_tol : 5.000000000000000e-006 geom_force_tol : 0.010000000000000 geom_stress_tol : 0.020000000000000 geom_disp_tol : 5.000000000000000e-004 geom_max_iter : 100 geom_method : BFGS fixed_npw : false geom_modulus_est : 500.000000000000000 GPa calculate_stress : true popn_calculate : false calculate_densdiff : false pdos_calculate_weights : false num_dump_cycles : 0 由此可以看出*.param文件为参数文件，具体意义和castep中的calculation TAB一样 2)*.xsd 为ms特有的晶体结构文件 3) SMCastep_Extension_*.xms 为计算任务文件 4)*.cell文件 %BLOCK LATTICE_CART 4.433337044187580 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 4.436194540426790 0.000000000000000 0.000000000000000 0.000000000000000 2.964214040510110 %ENDBLOCK LATTICE_CART 直角坐标系下晶格常数a,b,c %BLOCK POSITIONS_FRAC O 0.3056677837013660 0.3069474983283770 0.0000000000000000 O -0.3056677837013660 -0.3069474983283770 0.0000000000000000 O 0.1943322162986340 0.8069474983283771 0.5000000000000000 O 0.8056677837013661 0.1930525016716231 0.5000000000000000 Sn 0.00