槟榔江水牛LALBA基因克隆及序列特征分析-云南农业大学.PDFVIP

云南农业大学学报 （自然科学），２０１７，３２（５）：８３０－８３７ ｈｔｔｐ：／／ｘｂｙｎａｕｅｄｕｃｎ ＪｏｕｒｎａｌｏｆＹｕｎｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅ） Ｅｍａｉｌ：ｘｂ＠ｙｎａｕｅｄｕｃｎ ＤＯＩ：１０１６２１１／ｊｉｓｓｎ１００４－３９０Ｘ（ｎ）２０１７０５０１２ 槟榔江水牛ＬＡＬＢＡ基因克隆及序列特征分析 １＃ ２＃ ３ １ １ １ １ 单　曦 ，吉　丽 ，张永云 ，滕晓红 ，袁　峰 ，哈　福 ，苗永旺 （１．云南农业大学 动物科学技术学院，云南 昆明６５０２０１；２．云南农业职业技术学院畜牧兽医学院，云南 昆明６５０２１２； ３．云南农业大学 农科专业基础实验教学示范中心，云南昆明６５０２０１） 摘要：【目的】 －乳清蛋白由ＬＡＬＢＡ基因编码，在乳糖合成中起着重要作用。近年在普通奶牛中发现该基因 α 与泌乳性状关系密切，但在水牛中研究较少。为了揭示水牛ＬＡＬＢＡ基因的序列特征。 【方法】本研究采用 ＲＴ－ＰＣＲ测序法对槟榔江水牛ＬＡＬＢＡ基因的编码区序列进行了克隆和生物信息学分析。【结果】槟榔江水牛 ＬＡＬＢＡ基因的编码区全长４２９ｂｐ，编码蛋白含１４２个氨基酸。其 ＬＡ含有 １个 Ｃ型溶菌酶／乳蛋白家族结构 α 域 （ＡＡ２０～１３８）和１个信号肽序列 （ＡＡ１９～２０），无跨膜结构，是胞外分泌的亲水蛋白；其Ｎ末端疏水，Ｃ 末端亲水；有４类功能活性位点。基于ＬＡＬＢＡ基因编码区序列的系统发育分析表明，槟榔江水牛与牛亚科物 种聚在一起，揭示它们ＬＡＬＢＡ基因功能的相似性。在ＬＡＬＢＡ基因编码区共检测到５个 ＳＮＰ位点：ｃ６３Ａ＞Ｇ、 ｃ１０７Ａ＞Ｇ、ｃ１４７Ａ＞Ｇ、ｃ２４９Ｃ＞Ｔ、ｃ２９１Ｔ＞Ｃ。这些变异位点全部处于ＨａｒｄｙＷｅｉｎｂｅｒｇ不平衡状态，只有 ＳＮＰ１０７为异义替换，导致编码氨基酸由天冬氨酸变为甘氨酸。功能分析显示ＳＮＰ１０７对槟榔江水牛 ＬＡ功能 α 没有影响。【结论】水牛ＬＡＬＢＡ基因的序列与其他牛科物种长度相同，其编码产物的结构、功能与其他牛科 物种相似。本研究可为进一步研究ＬＡＬＢＡ基因在水牛泌乳过程中的作用机制奠定基础。 关键词：槟榔江水牛； 乳清蛋白；生物信息学分析；单核苷酸多态性；蛋白质功能 α 中图分类号：Ｓ８２３８３２　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００４－３９０Ｘ（２０１７）０５－０８３０－０８ Ｃｌｏｎｉｎｇ，ＳｅｑｕｅｎｃｅＣｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆＢｉｎｇｌａｎｇｊｉａｎｇ ＢｕｆｆａｌｏＧｅｎｅＬＡＬＢＡ １ ２ ３ １ １ １ １ ＳＨＡＮＸｉ，ＪＩＬｉ，ＺＨＡＮＧＹｏｎｇｙｕｎ，ＴＥＮＧＸｉａｏｈｏｎｇ，ＹＵＡＮＦｅｎｇ，ＨＡＦｕ，ＭＩＡＯＹｏｎｇｗａｎｇ （１．ＦａｃｕｌｔｙｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＹｕｎｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｋｕｎｍｉｎｇ６５０２０１，Ｃｈｉｎａ； ２．ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＡｎｉｍａｌＨｕｓｂａｎｄｒｙ＆Ｖｅｔｅｒｉｎａｒｙｍｅｄｉｃｉｎｅ，ＹｕｎｎａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＣｏｌｌｅｇｅｏｆＶｏｃａｔｉｏｎａｌ Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ，Ｋｕｎｍｉｎｇ６５０２１２，Ｃｈｉｎａ；３．ＴｅａｃｈｉｎｇＤｅｍｏｎｓｔｒａｔｉｏｎＣｅｎｔｅｒｏｆｔｈｅＢａｓｉｃＥｘｐｅｒｉｍｅｎｔｓｏｆ ＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＭａｊｏｒｓ，Ｙｕｎｎ