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H9亚型鸭源禽流感病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR快速检测方法的建立.pdf

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福建农业学报 25(4):387~391,2010 FujianJournalofAgriculturalSciences 文章编号 :1008—0384 (2O10)04—387—05 H9亚型鸭源禽流感病毒 SYBRGreen工实时荧光定量 RT~PCR快速检测方法的建立 万春和 ,林 避 ,施少华 ,林秋敏 ,陈红梅 ,程龙飞,傅光华 ,林 芳,林建生 ,黄 瑜 (福建省农业科学院畜牧兽医研究所 ,福建 福州 350013) 摘 要 :针对 H9亚型禽流感 HA基 因保守序列设计 引物 ,建立基于 SYBRGreenI检测模式的荧光定 量 RT—PCR (real—timeRT—PCR,RRT—PCR),最低检测 限为 8.33×10拷 贝质粒 DNA,与常规 PCR相 比,灵 敏度高出 100倍。扩增产物的熔解 曲线分析只出现 1个单特异峰,无引物二聚体,Tm值为 (83.83+-0.22)℃, 组 内变异系数为 0.52 ~1.48 ,组间变异系数为 0.71 ~2.21 ,可重复性好 ;对 H5亚型禽流感病毒、鸭 肝炎病毒、鸭瘟病毒、鸭源禽 1型副粘病毒无扩增 ;检测速度快,从样本处理到报告结果仅需 4.5h。 关键词:H9亚型禽流感病毒 ;SYBRGreenI;实时荧光定量 PCR (RRT—PCR) 中图分类 号:S855.3 文献标识码 :A SYBR Green工RT—PCR forrapiddiagnosisofH9SubtypeAvianInfluenzaVirus W AN Chun-he,LIN Su,SHIShao—hua,IAN Qiu—rain,CHEN Hong—mei,CHENG Long—fei,FU Guang—hua, IINFang,LINJian—sheng,HUANGYu (1.InstituteofHusbandryandVeterinaryMedicine,FujianAcademyoJAgriculturalSciences. Fuzhou,Fujian 350013,China) Abstract:A pairofspecificprimerstargetinghemagglutiningeneofH9avian influenzavirus(AIV)wasdesigned forthedevelopmentofaSYBR Green Ifluorescentbased real—timeRT —PCR (RRT —PCR)tOquantifytheH9 subtypeAIV forrapiddiagnosis.ThedetectionlimitofRRT —PCR was8.33×10 plasmidcopies.Themelting curveanalysisusingSYBR GreenIdyeshowedonespecificpeak atthemelting temperatureof(83.83±0.22)℃ withnoprimer-dimerspeak.Noamplificationwasdetectedbythismethodfrom theunrelatedRNA samples,such asH5subtypeAIV,duckhepatitisvirus,duckplaguevirusoravianparamyxovirustype一1.Highreproducibility wasobtainedfordetectingplasmidDNAwithintra—assayof0.52 一1.48V0andinter—assayof0.71 一2.21 . Keywords:H9subtypeavian influenzavirus;SYBR Green I;RRT —PCR H9N2亚型禽流感病毒 (avianinfluenzavirus, 源 ,是典型的禽源流感病毒。 AIV)最早于 1966年 由 Hommee等_l从火鸡体 内 目前 ,H9N2亚

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