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三个栽培种中天然彩色棉的遗传多样性及关联分析
棉 花 学报 Cotton Science 20 15袁27 渊4 冤院291―299 个栽培种中天然彩色棉的遗传多样性及关联分析 许鸿越 孙君灵 潘兆娥 贾银华 庞保印 杜雄明* ( 中国农业科学院棉花研究所/ 棉花生物学国家重点实验室 河南安阳455000) 摘要院 本研究利用主要农艺性状和SSR 标记分析了137 份陆地棉尧13 份海岛棉以及27 份亚洲棉等不同纤维 色泽的种质资源遥 170 对SSR 引物共检测到1036 个等位基因变异遥 其中有多态性的等位基因923 个 平均每 个SSR 位点有5.43 个等位变异 变化范围为1 10遥 位点多态性信息量渊PIC冤的变化范围为0.56 0.93 PIC 在0.85 以上的多态性SSR 位点为122 个遥 结果表明 实验材料存在着丰 的遗传多样性遥 在群体结构分析基 础上 使用TASSEL 软件中的混合线性模型(MLM) 在陆地棉 得到与11 个性状相关联的SSR 标记23 个曰 在海岛棉群体得到与5 个性状关联的17 个标记曰在亚洲棉 检测到与8 个性状关联的15 个标记位点遥 在三 个栽培种 与纤维色泽度相关的标记位点一共有6 个 分别是CIR51-4尧BNL1421-2尧BNL2656-2 尧DPL570-2尧 GH268-6 和TMB 131-1 表型变异解释率从3.12%到18.97%遥 三个栽培种 天然彩色棉种质具有丰 的遗传 多样性 为棉花的种间尧种内杂交育种以及拓宽棉花新品种的遗传背景提供了物质基础和理论依据遥 关键词院彩色棉曰遗传多样性曰关联分析曰SSR 标记 中图分类号院S562.024 文献标志码院A 文章编号院1002-7807(2015 04-0291-09 10.11963/issn.1002-7807.201504001 Xu Hongyue, Sun Junling, Pan Zhaoe, Jia Yinhua, Pang Baoyin, Du Xiongming* 渊 455000, Cotton germplasms with different fiber colors were analyzed using main agronomic traits and polymorphism mi- crosatellite markers (SSR); these included 137 upland cotton ( ) varieties, 17 island cotton ( ) varieties, and 27 Asiatic cotton ( ) varieties. In total, we detected 1036 allelic variations, including 923 polymorphic alleles, with 170 primer pairs. Each SSR locus averaged 5.43 alleles with a variation range of 1 to 10. Locus polymorphism information content (PIC) ranged between 0.56 and 0.93, and there were 122 SSR loci with PIC >0.85. Used a mixed linear model with TASSEL software, 23 SSR markers associated with 11 traits in , 17 markers associated with five traits in , and 15 markers associated with eight traits in . In the three cultivated species, six mark- ers were assoc
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