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计算机图形化技术在材料科学中的应用

第四章:计算机图形化技术在化学中的应用 化学化工领域内涉及图形化技术的领域 分子结构(包括平面结构和三维结构)的绘制 反应机理示意图(包括反应式)绘制 实验流程装置图绘制 生产和工艺流程图绘制 原子和分子微观状态图绘制及显示 化学过程(包括各种分离分析过程)图形化显示 实验数据的图形化制作和显示 讨论:利用计算机技术完成分子结构绘制都可以使用哪些方法?根据资源占用、使用方便、功能全面等角度考虑,分析不同方法的优劣。 常用化学图形化软件种类 分子结构绘制软件 分子模型绘制软件 化工装置和流程绘制软件(CAD) 化学实验装置绘制软件 实验数据处理与显示软件 除了第三条之外,一般把上述软件与化学数据库和电子报表等软件集成为化学办公软件 如何用占用资源最少,记录信息量最大,失真最小的方式描述一个分子结构? BMP, JPG, GIF, PNG, TIF, PCX, TGA, WMF, EPS等格式各有什么特点? 分子结构也是一种图形,有什么特点? 计算机平面静态图形文件分为两大类:一类是位图,在编辑位图时针对的是像素点而不是形状,位图放大会产生失真,存储时占较大空间;另一类是由函数集描述图像,占有少量空间及内存,因为是用数学函数描绘的,放大不会失真,但比较复杂的图像运算量非常大。 ⑴.BMP(bitmap)―是点位图格式, 支持24bit色彩,保存的图像质量不变,因为要保存每个像素的信息文件比较大。 ⑵.JPEG (Joint photographic exptrs group) ―是一种有损压缩方案(压缩比达20倍),比较常用于质量要求不高场合 ⑶.GIF (Graphics Interchange Format)--是一种图像交换格式,可提供压缩功能,但只支持256色,适合网上传输。 ⑷. PNG―是网景公司开发的新型格式,综合JPG和GIF格式的优点,支持24bit色彩,压缩不失真适合网络使用。 ⑹TIF (Tag Image File Format) ―是一种跨平台的位图格式, 采用的LZW压缩算法是一种无损失的压缩方案,常用来存储大幅图片。 ⑺.PCX―是一种跨平台格式, 是Windows与DOS之间进行图形文件交换的桥梁。 ⑻.TGA―是Windows与3DS进行图形交换的格式。在实用中可以将动画通过视频软件转入电视。 ⑼.WMF (Metafile) ―是一种清晰简洁的矢量图形格式, 无论放大还是缩小,图形的清晰度不变, 用于Word中。 ⑽.EPS――Adobe公司绘图软件Illustrator的矢量图格式,EPS格式常用于位图与矢量图之间交换文件。 几种常见化学结构文件格式 Molecule files: Each molfile describes a single molecular structure which can contain disjoint fragments. Rgroup files: An RGfile describes a single molecular query with Rgroups. Each RGfile is a combination of Ctabs defining the root molecule and each member of each Rgroup in the query. Reaction files: Each rxnfile contains the structural information for the reactants and products of a single reaction. MDL currently has two types of rxnfiles: the REACCS type and the CPSS-rxnfile written by CPSS programs Structure-data files: An SDfile contains structures and data for any number of molecules. Together with RDfiles, SDfiles are the primary format for large-scale data transfer between MDL databases. Reaction-data files: Similar to SDfiles in concept, the RDfile is a more general format that can include reactions as well as molecules, together with their associated data. RD

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