类风湿关节炎外周血lncrna差异表达研究.pdfVIP

夏摇 燕等摇 类风湿关节炎外周血lncRNA差异表达研究摇 第1期 ·9 · doi:10.3969/ j.issn.1000鄄484X.2016.01.002 ·基础免疫学 · 类风湿关节炎外周血lncRNA差异表达研究淤 于 夏摇 燕摇 冯摇 佳摇 陈安平摇 杨年安摇 向摇 阳摇 苏林冲 摇 袁摇 林 (湖北民族学院风湿性疾病发生与干预湖北省重点实验室,恩施 445000) 摇 摇 中图分类号摇 R593郾22摇 摇 文献标志码摇 A摇 摇 文章编号摇 1000鄄484X(2016)01鄄0009鄄05 [摘摇 要]摇 目的:筛选长链非编码 RNA(lncRNA)在类风湿性关节炎患者 PBMCs 和正常人 PBMCs 中差异表达,分析 lncRNA在RA发病中的可能作用。 方法:选取2014年湖北民族学院附属民大医院风湿免疫科就诊的12例RA患者和11例 正常对照组。 利用Agilent human lncRNA芯片检测3例RA患者PBMCs和3例正常人PBMCs 中lncRNA和mRNA表达,GO 及Pathway分析差异表达的lncRNA功能分布,构建lncRNA鄄mRNA 的共表达网络,并在此基础上通过Cis鄄和Trans鄄预测可能与 RA相关lncRNA。 结果:RA患者中差异表达的lncRNA共有1615条,差异表达的mRNA共有878条,GO分析发现差异表达 的mRNA主要参与金属离子结合、蛋白激酶结合、转录调节及核苷酸结合等。 Pathway分析发现差异表达的mRNA 主要参与 TNF信号通路、B细胞受体信号通路、前列腺癌、系统性红斑狼疮、子宫内膜癌等。 经 Cis鄄和Trans鄄预测发现,REL、SMAD3 和 ETS1可能与RA 的发生密切相关,因此考虑与之相关的lncRNA:NONHSAG027875、FR378506和NONHSAT031501也可能参与 了RA 的发生。 结论:RA患者外周血中差异表达的lncRNA可能与RA 的发生和发展密切相关,未来可能成为RA潜在治疗 靶点。 [关键词]摇 长链非编码RNA(lncRNA);类风湿性关节炎;PBMCs Study on expression of long non鄄coding RNA in rheumatoid arthritis XIA Yan,FENGJia,CHENAn鄄Ping,YANGNian鄄An,XIANG Yang,SULin鄄Chong,YUAN Lin郾HubeiProvincialKey Laboratory of Occurrence and Intervention of Rhumatic Diseases of Hubei University for Nationalities,Enshi 445000,China [Abstract]摇 Objective:To investigate the expression profile variation of long non鄄coding RNA(lncRNA)in the peripheral blood mononuclear cells of rheumatoid arthritis (RA)and healthy controls,and explore the role of lncRNA in the pathogenesis of RA郾Methods:A total of 12 RA patients and 11 age鄄matched healthy controls from University Hospital of Hubei University for Nationalitieswere recruited郾Using lncRNA microarray technologytodetect differently expressedlncRNAsin3 casesof RAPBMCsand 3 cases ofhealthycontrols郾GOandPathwayanalysiswasperformed郾Thecoding鄄non鄄codinggeneco鄄expressionnetworksoflncRNAand mRNAwasconstructedbasedonthecorrelationanalysi