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SURFLEX DOCK 分子对接
最优秀的分子对接工具—Surflex-Dock 温 夏 夏 计算机辅助药物设计 药物设计方法 基于配体的药物设计 基于受体的药物设计 QSAR 药效团模型 SurflexDock 从头设计 分子对接 Topomer CoMFA 虚拟筛选 同源模建 组合库设计 Surflex-Dock简介 • 简介：Surflex-Dock是一种快速准确的分 子对接方式，它采用独特的经验打分函数 和拥有专利的有哪些信誉好的足球投注网站引擎（基于分子相似性 有哪些信誉好的足球投注网站引擎）将配体分子对接到蛋白的结合 位点。 • 作用：研究小分子配体和大分子蛋白之间 的结合模式和相互作用，预测或者解释分 子的活性。 Surflex-Dock优点 – 原型分子引导的分子对接 – 环的柔性处理或者限制性对接 – 准确的评分（多种打分函数） – 快速的对接(对接每个分子只需要2s不到) – 易于操作(蛋白/对接准备工具) – 支持并行 4 Surflex-Dock s t p r r u e c p t a u r r e e 大分子数据库 结构准备 分子对接 测试 O N+ O - S D u O o r f O c l k e 小分子数据库 构象 x 有哪些信誉好的足球投注网站 Surflex-Dock原理 – Surflex-Dock使用原型分子（Protomol）表示蛋 白的结合口袋 N-H CH4 + C=O 探针探测蛋白口袋表面性质：疏水、氢键、静电 蛋白质活性口袋的负像 Ruppert, J., W. Welch, et al. (1997). Automatic identification and representation of protein binding sites for molecular docking. Protein Sci 6(3): 524-33. Surflex-Dock原理 • 原理：prot
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