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ppt课件-蛋白质的分离纯化与定性定量分析
Ion-Exchange chromatography Ion-Exchange chromatography Size-exclusion chromatography Size-exclusion chromatography Affinity chromatography Affinity chromatography Commonly used affinity columns: Ni2+ ? binds to poly Histines (example 6xHis) Specific antibodies (anti-Flag tag) glutathione ? binds to GST Protein A or G ? binds antibodies Affinity chromatography Possible elution strategies: pH Ion strengh Denature Competitor ligand or analog Ni-NTA columns The high affinity of the Ni-NTA resins for 6xHis-tagged proteins or peptides is due to: 1- the strength with which these ions are held to the NTA resin 例如: 凝胶过滤法得到的蛋白质分子量:180kD SDS(不加还原剂)结果:45kD SDS(加还原剂)结果:两条蛋白带(15kD和30kD) 则结论是: 该蛋白质由4个相同的亚基组成,每个亚基由两条多肽链经二硫键连接而成,两条多肽链的分子量分别为15kD和30kD。 质谱法是最精确的分子量测定方法 质谱( Mass Spectrometry,MS)是带电原子、分子或分子碎片按质荷比(m/z)的大小顺序排列的图谱。 由于ESI和MALDI两大电离技术的出现,质谱技术已广泛应用于蛋白质研究领域,包括蛋白质分子量测定。精确度0.01~0.1%。 其他常用的蛋白质相关技术 蛋白质纯度的判定:HPLC、SDS、质谱 蛋白质序列测定技术:Edman测序法、质谱 蛋白质的空间结构测定:X射线晶体衍射分析、核磁共振 目前常用的印迹法有四种: Southern blot 检测DNA Northern blot 检测RNA Western blot 检测蛋白质 印迹法最常用的固体材料有硝酸纤维素(NC)膜和PVDF膜。 为减少非特异性干扰,需对固相载体进行处理,即用一种与待测物不反应的物质如蛋白质、核酸、吐温20等封闭载体上印迹以外的剩余吸附点(该过程称为封闭),使探针仅与印迹物起反应,且不吸附到载体上。 探针是用化学方法将能与待研究蛋白质结合的物质如抗体,与某些标示物如酶、同位素或荧光物质、半抗原等结合形成的复合物。 蛋白质印迹最常用的探针是酶联抗体(HRP酶或AP酶)。 Western blotting原理图示 蛋白质印迹的用途 用于检测样品中是否有特定蛋白的存在,并进行半定量分析。 基本操作步骤 样品的制备 细胞裂解物的蛋白定量 细胞裂解物的SDS蛋白质的转移 目的蛋白的检测 免疫印迹技术的注意事项 不能绝对定量,只能相对定量 各样品的上样量必须相同 选择合适的胶浓度 正负电极要确认 充分封闭 驱除气泡 注意保护膜,不能干燥 优点 样品加样位置和体积不受限制; 分辨率高于其它类型电泳; 可测定pI值; 缺点 样品在pI区域易沉淀,为增加样品溶解度,可以在胶中加入尿素,但导致蛋白质失活; 样品前处理麻烦。 等电聚焦的优缺点 3. 双向电泳 将等电聚焦技术与SDS技术组合起来的新技术,是目前分离蛋白质混合物最强大的技术,也是蛋白质组学研究的重要技术。 基本步骤:第一相等电聚焦后,在等电聚焦的垂直的方向进行第二相SDS。 pH 3 - - - - - - 10 (1) IEF 等电聚焦电泳 (2) SDS(3) 染色脱色 考马斯亮蓝 银 染 可综合利用层析和电泳分离纯化蛋白质 蛋白质的浓缩 超滤法 使用特制薄膜对溶液中的溶质分子进行选择性过滤的技术。 常用离心力使蛋白质透过滤膜,而使蛋白质截留在膜内。 冷冻干燥法 在冷冻状态下使样品中水分升华而浓缩蛋白质的技术,保持蛋白质构象的最好方法。 注意:必须保证蛋白质始终处于冷冻状态(在-70℃冰箱预冷),为提高溶解度可加赋形剂(右旋糖酐、甘露醇等)。 吸收法 采用吸水剂直接吸去蛋白质溶液中的水。 PEG、蔗糖、凝胶干粉等。 沉淀法 硫酸铵、PEG、有机溶剂沉淀; 免疫沉淀。 3.
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