G03W 的安装、初始化.pptxVIP

G03W 的安装、初始化和作业启动 Gaussian 03 for Windows Tutorial-1 2010试用版 G03 的主要计算功能 可用来预测气相和液相条件下，分子和化学反应的性质 ： 分子的能量和结构 过渡态的能量和结构 振动频率 红外和拉曼光谱 热化学性质 成键和化学反应能量 化学反应路径 分子轨道 原子电荷 电多极矩 NMR屏蔽和磁化系数 自旋-自旋耦合常数 振动圆二色性强度 电子圆二色性强度 g张量和超精细光谱的其它张量 旋光性 振动-转动耦合 非谐性的振动分析和振动-转动耦合 电子亲和能和电离势 极化和超极化率（静态的和含频的） 各向异性超精细耦合常数 静电势和电子密度 各项计算可针对体系的基态或激发态进行 G03 的程序结构 包含74个程序链接模块 (Link)，分别构成12个程序覆盖段 (Overlay) link0: 初始化程序，控制overlay link1: 读入并处理Route Section，建立要执行的link列表 link9999: 终止计算 其中 ： G03W的功能和程序结构 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03W 各模块功能一览 G03的基本模块和功能 读入并处理Route Section 读入分子特性参数 确定分子对称性（点群和阿贝尔子群） 设定和配置基集，计算单电子积分 产生MO的初始猜测 叠代解 SCF 方程 指认MO对称性, 打印MO波函数并进行 Mulliken 布居分析 结束作业 图中所示为G03作业必须执行的基本模块 G03W软件的安装和运行环境设定 G03W 的安装 硬件环境： 基本配置：内存2GB、安装后硬盘分区的自由空间10GB 建议配置：内存3.5GB (for WinXP)、或=4GB (for Windows 7)、硬盘自由空间20GB（可最有效地利用计算机资源，最大限度发挥效率和计算容量） 安装位置 建议将G03W安装于D或E盘。理由：保护程序文件及积累的输入、输出和有用的中间文件。万一须格式化C:\ 盘时不致丢失 按此处置，在Windows系统重装后G03W也不必重装 软件安装： 启动Setup.exe，按屏幕提示输入软件的“Serial Number”并设定安装路径，自动完成安装。 G03W 根目录下的文件和子目录 根目录下共计118个文件和9个子目录 定制缺省的许用内存和硬盘空间 在子目录\Scratch下创建Default.Rou文件对缺省值进行设定 可用Notepad或其它文本编辑器打开并修改 “W”是Gaussian程序使用的内存单位─ “双精度字”，相当于 8 字节 (byte) ∴ 1MW=8MB; 1GW=8GB G03W在根目录下提供了 3 个文件 Default.r1 Default.r2 Default.r3 供用户做创建Default.Rou文件的样板 定义内存和硬盘空间的可用单位是 MB、MW、GB和GW 编制Default.Rou文件的实例 打开Default.r3文件并进行修改 定制取值根据计算机的内存和硬盘分区自由空间大小而定。一般宜为Windows系统和其它应用软件留出不少于1GB的内存空间 将修改毕的文件改名为 Default.rou保存到 G03\Scratch 子目录下 -M- 1GB -#- MaxDisk=10GB 所采用的定制是内存=1GB，硬盘10GB（适用于总内存为2GB的计算机） G03W程序界面和工具栏 G03W用户界面 下拉窗口栏 图形工具栏 当前计算信息显示区 当前作业进程指示栏 用户界面的条形工具栏 File 下拉菜单的命令 点击“File”打开下拉菜单 在线创建新作业 打开一个输入文件 修改旧的输入文件 程序的初始化设置 在Process拉菜单的命令 点击“Process”打开下拉菜单 暂停当前作业 当前Link后暂停 恢复运行当前作业 终止当前作业 启动批处理作业 本作业结束后 终止批处理 立即终止批处理 Utilities下拉菜单的命令 不同格式分子结构文件的转换 读取*.fch文件中的数据 并生成3D网格 用*.chk文件中的MO波函数生成 电子密度和静电势空间网格 从*.chk文件中打印 频率和热化学数据 编辑批处理作业文件 将*.chk文件转换为可供 Chem3D读入的*.fch文件 将*.fch还原为*.chk文件 显示指定*.chk文件中的 作业执行路径行和标题行 将*.chk文件转换为*.txt格式 显示指定*.chk文件中的 作业执行路径行和标题行 打开指定的 3D 分子结构浏览器 程序的初始化设置 点击“