后基因组时代人类遗传.pdf

后基因组时代的人类遗传学 Marco F Ramoni 儿童医院信息学项目 哈佛大学医学院 HST 950 (2003) 哈佛-麻省理工学院健康科学与技术部 HST950J ：医学计算 （人名） 引言 2001年2月12 日，人类基因组计划宣布，第一张人类基因组草图绘制完毕。 在这公告的议程条款中，一份声明凸现出来。一份SNP （单链核苷酸多态性）图有望为绘 制人类疾病图和追踪人类史带来革命。 SNP 即单链核苷酸多态性，人类基因组在个体的细微变异。 你可把这宣判为群体遗传学的新时代。 概要 背景 研究和实验设计 80年代的革命与 HGP 病例对照研究 遗传多态性 家系研究 本质 分析方法 多态型 关联分析 建立 连锁分析 术语 等位基因均分研究 法则 QTL基因定位 遗传型 新方法 复杂性 单倍体 定义 HapMap 复杂性因素 htSNPs 直觉：我们可找到表面特征的遗传学基础而不必知道实际的编码运作。 起因：Sturtevant于1913年找到了性状遗传基因。 早期事件：植物和动物的基因图谱。 动机：无标志物鉴别编码区。 标记物：1977年Botstein 指出，自然发生的DNA已包含识别基因组区的标记物， 这就是基因的多态性。 分子生物学中心法则 性状 疾病 DNA RNA MRNA 蛋白质 生理 代谢 抗药性 80年代的革命与HGP •多态现象可作为生物标志物的直觉点燃了这场革命。 •孟德尔疾病（单基因遗传病） 常染色体显性遗传(Huntington) 常染色体隐性遗传 （C 纤维变性） X-连锁显性（Rett ） X-连锁隐性(Lesch-Nyhan) • 目前，已确认的单基因疾病超过了400种 。 •这使HGP有了新的曙光。 术语 等位基因：DNA 碱基序列。 位点：等位基因在基因链中的自然位置。 连锁：存在于同一染色体上的两位点的亲密关系。 标记物：染色体上一已标明位置的等位基因 两等位基因间的碱基对数 厘摩：两等位基因间的盖然距离 表型：一外在