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PyMOL的应用简介
PyMOL的应用简介 Brief-instruction of PyMOL 报告人：王帅 组员：孙亮、高明、李倩倩、王帅(组长) 单位：CAAS.G13 研究所：哈尔滨兽医研究所 2012/7/3 1 目录 • PyMOL的概述 • PyMOL的界面介绍 • PyMOL的基本界面操作 • PyMOL对蛋白质实例解析 • PyMOL命令操作简介 2012/7/3 2 PyMOL的概述 • PyMol 是一款多平台分子三维图像显示软件，由Warren Lyford DeLano编写，被用来创作高品质的分子 （特别是生 物大分子如蛋白质）三维结构。Pymol名字的来源： “Py ” 表示该软件基于python这个计算机语言， “Mol ”则是英 文分子 （molucule ）的缩写，表示该软件用来显示分子结 构。据软件作者宣称，在所有正式发表的科学论文中的蛋 白质结构图像中，有四分之一是使用Pymol来制作的。 2012/7/3 3 PyMOL的界面介绍 • PyMOL界面分为2个窗口，外 部GUI窗口（External GUI）和 Viewer Window 。 • Viewer Window又分为左右两 块，左边用来显示结构图像的 （Viewer ），右边则是一个内 部GUI窗口（Internal GUI)。 • Viewer 自身包含一个命令行 （如图中左下方的PyMOL提 示符），可以用来输入Pymol命 令；在Inernal GUI中则可以选 定一些特定的对象并完成一些 操作。 • External GUI则包含一个标准菜 单、一个输出区、一个命令行 输入区以及右边的一些常用命 令按钮。 2012/7/3 4 PyMOL的界面介绍
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