玉米生物诱导孤雌生殖DH群体地SNP偏分离分析.PDFVIP

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玉 米 科 学2015,23(3):8~14 JournalofMaizeSciences 文章编号:1005-0906(2015)03-0008-07 DOI:10.13597/ki.maize.science 玉米生物诱导孤雌生殖DH群体的 SNP偏分离分析 1,2 2 2 2 2 2 1 许理文 ,段民孝 ,宋 伟 ,田红丽 ,王凤格 ,赵久然 ,王守才 (1.中国农业大学农学与生物技术学院,北京 100193;2. 北京市农林科学院玉米研究中心,北京 100097) 摘 要:以单交种先玉335作母本,与京科诱006单倍体诱导系杂交,产生单倍体及秋水仙素加倍形成双单倍 体(DH)群体,用SNP芯片对DH群体进行基因型分析,获得1337个在先玉335的双亲间有多态的SNP数据,对SNP 进行卡方检测(P0.05),发现516个SNP表现偏分离,占38.6%,这些偏分离SNP中有285个偏向母本PH6WC,占 55.2%;231个偏向父本PH4CV,占44.8%。在玉米的8条染色体上,发现10个偏分离热点区域(SDR),分析SNP的χ2 2 值与其在染色体上的位置之间的关系发现,χ值最大的SNP往往在SDR的中心位置。 关键词:玉米;SNP;偏分离;加倍单倍体 中图分类号:S513.035.2 文献标识码:A SegregationDistortionstudyonBio-inducedParthenogenesis-derived DoubledHaploidLinesofMaizebySNP 1,2 2 2 2 2 2 1 XULi-wen ,DUANMin-xiao,SONGWei,TIANHong-li,WANGFeng-ge,ZHAOJiu-ran,WANGShou-cai (1.CollegeofAgricultureandBiotechnology,ChinaAgriculturalUniversity,Beijing 100193; 2.MaizeResearchCenter,BeijingAcademyofAgriculturalandForestrySciences,Beijing 100097,China) Abstract:Haploidsoriginatingfromthehybrid,Xianyu335(PH6WC×PH4CV)werecrossedwiththehaploidin⁃ ducer,Jingkeyou006andtheresultingdoubledhaploidlines(DHs)wereobtainedbychromosomedoublingwithcol⁃ chicine.Atotalof 1337SNPmarkersdetectedpolymorphismbetweenPH6WCandPH4CV.Among1337SNP,cov⁃ eringwholemaize 10chromosomes,fivehundredandsixteenSNP(38.6%)showedthegeneticdistortion(P0.05).Of thetotalsegregationdistortionSNP,twohundredandeighty-fiveSNP(55.2%)deviatedtowardfemaleparent, PH6WC,while 231 SNP(44.8%)deviatedtowardmaleparent,PH4CV.Total

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