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基于ITS和cpDNA序列的中国野生葡萄分子系统进化AMolecular
分子植物育种(网络版), 2011 年, 第9 卷, 第1570-1578 页 Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2011, Vol.9, 1570-1578 http://mpb. 5 研究报告 A Letter 基于ITS 和cpDNA 序列的中国野生葡萄分子系统进化 张永辉 , 樊秀彩 , 张颖 , 孙海生 , 姜建福 , 刘崇怀 中国农业科学院郑州果树研究所, 郑州, 450009 通讯作者: iuchonghuai@; 作者 分子植物育种, 2011 年, 第9 卷, 第78 篇 doi: 10.5376/.2011.09.0078 收稿日期:2011 年05 月16 日 接受日期:2011 年06 月13 日 发表日期:2011 年06 月22 日 这是一篇采用Creative Commons Attribution License 进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条 件的使用与传播。 引用格式: 张永辉等, 2011, 基于ITS 和cpDNA 序列的中国野生葡萄分子系统进化, 分子植物育种 Vol.9 No.78 (doi: 10.5376/.2011.09.0078) 摘 要 我国是葡萄属植物的主要起源地之一,也是世界葡萄属植物种类最多,遗传资源最为丰富的国家之一。迄今为止, 已知起源于我国的葡萄属植物共有38 个种1 个亚种和7 个变种。如此丰富多彩的葡萄属种质资源不仅对葡萄科学的发展有 重大意义,也是阐明世界葡萄起源、演化和生物多样性必不可少的重要证据。利用核糖体转录间隔区(ITS)和3 个叶绿体DNA (cpDNA)序列(atpF-atpH ,trnH-psbA 和trnL-trnF)对 16 个中国葡萄野生种、变种及其近缘植物的22 份材料的亲缘关系和分 子系统进化进行研究。以圆叶葡萄为外类群,首次利用ITS 和cpDNA 序列构建了中国野生葡萄的分子系统发育树。叶绿体 DNA 序列构建的系统发育树显示,22 份材料之间的亲缘关系与其在不同大陆间的地理分布一致;ITS 构建的系统发育树显 示,22 份材料的30 个克隆可分成2 个主要分枝,其中分枝E 又可分为4 个亚分枝,由于多重核糖体DNA 序列等因素影响, ITS 树存在塌陷,ITS 系统进化树结果较为复杂,仅能部分揭示22 份材料之间的亲缘关系;综合分析cpDNA 序列和ITS 序 列的聚类结果,初步推断‘燕山葡萄0947’为母本为中国野生葡萄的一个种,父本为河岸葡萄的种间杂种;初步推断桑叶葡萄 为一个独立的中国葡萄野生种。 关键词 中国野生葡萄; 核糖体转录间隔区; 叶绿体DNA 序列; 亲缘关系 A Molecular Phylogenetic Study of Chinese Wild Vitis (Vitaceae) Based on Internal Transcribed Spacer and Chloroplast DNA Sequence Zhang Yonghui , Fan Xiucai , Zhang Ying , Sun Haisheng , Jiang Jianfu , Liu Chonghuai Zhengzhou Fruit Research Institute ,The Chinese Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou, 450009, P.R. China Corresponding author, liuchonghuai@; Authors Abstract As one of the major original centers of Vitis species, China has abundant genetic resources in
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