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2017-09-10 发布于天津
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tmk160906002 _ homo_sapiens _ 报告

TMK160906002 _ Homo_sapiens _ 报告项目编号：TMK160906002 物种：Homo_sapiens 分析类型：lncRNA 测序分析目录  质控分析测序数据质控参考序列比对 RNA-seq 质量评估  lncRNA 分析 lncRNA 转录本拼接候选novel lncRNA 筛选 lncRNA 表达水平分析 lncRNA 靶基因预测差异lncRNA 靶基因富集  mRNA 分析可变剪切分析 SNP 和InDel 分析 mRNA 表达水平分析差异mRNA 富集分析差异mRNA 蛋白互作分析  lncRNAmRNA 分析表达水平比较结构比较差异lncRNA 与mRNA 网络互作测序数据质控 1.测序数据统计高通量测序(如Illumina HiSeqTM2500)得到的原始图像数据文件经CASAVA 碱基识别(Base Calling)分析转化为原始测序序列（Sequenced Reads ），我们称之为Raw Data 或Raw Reads ，结果以FASTQ(fq)文件格式存储，其中包含测序序列（reads ）的序列信息以及其对应的测序质量信息。 FASTQ 格式文件中每个read 由四行描述，如下： @HWI-ST1276:71:C1162ACXX:1:1101:1208:2458 1:N:0:CGATGT NAAGAACACGTTCGGTCACCTCAGCACACTTGTGAATGTCATGGGATCCAT + #55???BBBBB?BA@DEEFFCFFHHFFCFFHHHHHHHFAE0ECFFD/AEHH 其中第一行以“@”开头，随后为Illumina 测序标识别符(Sequence Identifiers)和描述文字(选择性部分) 第二行是碱基序列第三行以“+”开头，随后为Illumina 测序标识别符(选择性部分) 第四行是对应碱基的测序质量，该行中每个字符对应的ASCII 值减去33 表 1 Illumina 测序标识符详细信息标识符详细信息 HWI-ST1276 Instrument – unique identifier of the sequencer 71 Run number – Run number on instrument C1162ACXX FlowCell ID – ID of flowcell 1 LaneNumber – positive integer 1101 TileNumber – positive integer 1208