est-snp开发软件特性分析及比较-生命的化学.pdfVIP

下载本文档

2
0
约3.02万字
约 6页
2017-09-03 发布于天津
举报
版权申诉

est-snp开发软件特性分析及比较-生命的化学.pdf

1、本文档共6页，可阅读全部内容。
2、有哪些信誉好的足球投注网站（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。
3、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
5、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
6、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
7、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
8、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次，网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档

est-snp开发软件特性分析及比较-生命的化学

《生命的化学》2011 年31 卷6 期 · 906 · ●Technique and Method CHEMISTRY OF LIFE 2011，31(6) 文章编号: 1000-1336(2011)06-0906-06 EST-SNP 开发软件特性分析及比较 1 1 2 1 李猛郭大龙刘崇怀张国海 1河南科技大学林学院，洛阳 471003 2 中国农业科学院郑州果树研究所，郑州 450009 摘要：利用生物信息学软件，对表达序列标签(EST)序列进行单核苷酸多态性(SNP)开发目前已较为普遍，其方法简单实用，且软件数量较多，可分为需要测序峰图的开发软件和不需要测序峰图的开发软件。对有测序峰图的序列进行开发， SNP SNP SNP 操作步骤较少且结果较为精确；对无测序峰图的序列进行开发可大批量操作且成本较低。本文针对这两类软件进行分析比 SNP 较，阐述开发流程，重点分析以公共数据库中序列为基础的开发过程，并对其各种使用参数加以说明，旨在 EST-SNP EST SNP 为EST-SNP开发提供参考，提高效率。关键词：SNP；软件分析；测序峰图；EST序列中图分类号：Q81 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, 假阳性率低，同时还能鉴定出由组成的单体型 SNP SNP)是指基因组内DNA某一特定核苷酸位置上的转 (haplotype)；缺点是工作量大，花费高，非一般的实换、颠换、插入、缺失等变化。一般情况下，我们验室能独立完成。因而此方法只用于特定的开发 SNP [1] [6] 所指的不包括碱基的插入与缺失。作为近 SNP SNP 和验证；利用生物信息学的方法。该方法是利用 (2) 年来出现的第三代遗传标记，目前已广泛应用于遗生物信息学软件从核酸数据库中开发，通过软件 SNP [2] [3] [4] 传连锁图谱构建、多样性分析、品种鉴定和重自动识别序列中的多态性位点，从而得到候选，