基于16SrDNA序列4株鸡源芽孢杆菌的分子鉴定-广东农业科学.PDF

130 广东农业科学 2014 年第 22 期 基于16S rDNA 序列4 株鸡源 芽孢杆菌的分子鉴定 秦翠丽 杨若岚 李松彪 李云飞 牛明福 宫 强 (河南科技大学食品与生物工程学院袁 河南 洛阳 471023) 要 对分离自肉鸡肠胃的4 株芽孢杆菌 R 尧R 尧S 尧H 的 16S rDNA 序列进行 PCR 扩增并测定其核酸序列袁在 1 2 1 1 NCBI 中通过 Nucleotide BLAST 查找其同源序列袁应用 DNAstar 的MegA lign 软件中的Jotun Hein尧Clustal V尧Clustal W 3 种方法进行序列差异和同源性分析袁分别使用 Mega5.0 软件中的最大似然法尧邻接法尧最小进化法尧最大简约法构 建系统发育树遥 序列差异和同源性分析结果显示院由Jo tun Hein 法可知袁H1 和 R2 与 Bac illus s ubtilis DSM10 同源性最 高袁达到 100% 曰R1 与 B. v allis mortis DSM11031 同源性最高袁达到 99.7% 曰H1 与 B. s ubtilis DSM10 的同源性为 99.9% 遥 由Clustal V 法可知袁H1 与 R2 同源性最高袁达到 99.6% 曰R1 与 S1 同源性最高尧为 98.7% 遥 由Clustal W 法可知袁H1 与 R2 同源性最高尧为 99.7% 袁R1 与S1 为 99.4% 遥 采用 4 种方法构建的系统发育树基本一致袁可以确立 4 株鸡源芽孢杆菌的 分类地位袁R 尧S 与 B. s ubtilis BPRIST009 尧B. s ubtilis LXB3 尧B. v allis mortis DSM11031 之间关系最为亲近曰R 尧H 与 B. 1 1 2 1 s ubtilis CICC10076尧B. s ubtilis DSM10 之间关系最为亲近遥 关键词 芽孢杆菌曰 16S rDNA 曰 分子鉴定 中图分类号 Q93-331 曰Q933 文献标识码 A 文章编号 1004-874X 2014冤22-0130-05 Molecular identification of four strains of Bacillus from broiler based on 16S rDNA sequences QIN Cui-li, YANG Ruo-lan, LI Song-biao, LI Yun-fei, NIU Ming-fu, GONG Qiang (Colle ge of Food and Bioe ngine e ring, He nan Univ e rs ity of Sc ie nc e and Tec hnology , Luoyang 471023, China) A bstract: 16S rDNA sequences of 4 Bac illus R , R , S , H , which