MPI并行编程实验报告.docVIP

姓名 学号 实验 成绩 计算机系统结构 实验报告 课 题：MPI并行编程实验 起讫日期：2012-05-20 ~ 2012-06-15 组 名：第四组 院 系：计算机学院 专 业：计算机科学与技术 指导老师：XXX 教授 2012年6月15日 实验一 Linux下基于MPI的hello程序设计 Author：姓名 一、MPICH并行计算库安装 在Linux环境下安装MPICH执行环境，配置MPD.CONF, 完成实验室中临近机器间的并行配置。 概要：以寝室四台计算机为例，设置IP（192.168.1.1~192.168.1.4），更改主机名为node01,node02,node03, node04。 （一）创建SSH信任连接 1、更改/etc/hosts文件 #vi /etc/hosts 打开hosts文件，更改如下： 127.0.0.1 localhost.localdomain localhost 192.168.1.1 node01 192.168.1.2 node02 192.168.1.3 node03 192.168.1.4 node04 2、在node01生成SSH秘钥对. #ssh-keygen -t rsa 一路回车即可 产生.ssh文件, #ls -a 查看是否有.ssh文件夹 3、进入.ssh目录 #cd .ssh 4、生成authorized_keys文件 #cp id_rsa.pub authorized_keys 5、退出到root目录 #cd .. 6、建立本身的信任连接 #ssh node01 按提示输入yes（三个字母要打全） 7、设置node02（node02的root目录下） #ssh-keygen -t rsa 生成.ssh文件夹 #scp node01的IP：/root/.ssh/* /root/.ssh 拷贝node01上的.ssh文件夹覆盖本地的 #scp node01的IP：/etc/hosts /etc/hosts 拷贝node01上的hosts文件覆盖本地的 #ssh node01 提示处输入yes回车 设置node03,node04的方法与node02相同 8、确认四台机器的信任连接已建立 对每个节点执行： #ssh node01 #ssh node02 #ssh node03 #ssh node04 在提示处输入yes回车，最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆（Last login:时间日期提示信息除外） （二）安装MPICH2 1、解压缩文件包 #tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz 2、创建安装目录 #mkdir /usr/MPICH-instsll 3、进入mpich2解压目录 #cd mpich2-1.0.1 4、设置安装目录 #./configure --prefix=/usr/MPICH-install 5、编译 #make 6、安装 #make install 7、退出到root目录 #cd .. 8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量 #vi .bashrc 修改后的.bashrc文件如下： # .bashrc # User specific aliases and functions alias rm=rm -i alias cp=cp -i alias mv=mv -i PATH=$PATH:/usr/MPICH-install/bin 新增加的 #Source global definitions if [ -f /etc/bashrc ]; then ./etc/bashrc fi 9、测试环境变量设置 #source ~/.bashrc #which mpd #which mpicc #which mpiexec #which mpirun 10、修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword #vi /etc/mpd.conf 设置文件读取权限和修改时间 #touch /etc/mpd.conf #chmod 600 /etc/mpd.conf 11、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts #vi mpd.hosts 文件内容如下： node01 node02 node03 node04 （三）配置NFS 为了方便 MPICH 的安装及并行程序的运行,最好将 MPICH的安装目录及用户家目录通过 NFS 网络文件系统共享。对于仅包含几个结点的较小的集群系统,可以任意指定其中一个结