柑橘黄龙病赣南脐橙内生菌种群结构分析.PDF

微生物学通报 Mar. 20, 2017, 44(3): 631−638 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160418 研究报告 柑橘黄龙病赣南脐橙内生菌种群结构分析 * 熊大维 金丹凤 顾斌涛 黄国昌 黄筱萍 刘兰 ( 330096) 摘 要：【目的】分析赣南脐橙黄龙病植株和健康植株叶片内生菌，对比不同培养条件下培养 出的内生菌，为筛选出对柑橘黄龙病原菌有影响的伴生菌奠定理论基础。【方法】通过PCR 方法对脐橙中黄龙病菌进行验证，并基于 16S rRNA 基因高通量测序技术对患病与健康赣南 脐橙叶片内生菌以及不同培养基富集培养后的内生菌进行多样性分析。【结果】所采集样品中 有 5 株患病株，5 株健康株。5 株病株中共同含有的细菌属有 13 个，其中7 个在5 株健株中 也共同存在。Defluviicoccus 属和 Granulicella 属在病健株植物中都是优势菌属，且在健株中 的平均含量高于病株。病株与健株的样品相似度存在明显界线。富集培养后不同样本和不同 培养基中菌属分布不同。肠杆菌属(Enterobacter) 、短小杆菌属(Curtobacterium) 、假单胞菌属 (Pseudomonas)和泛菌属(Pantoea)得到了大量富集，不动杆菌属和沙雷氏菌属等 9 个菌属富集 量较少。另外，培养和未培养各样本间未分类菌(Unclassified)含量差异也较大。【结论】赣南脐 橙患病植株和健康植株叶片内生菌有着明显差异，黄龙病菌的存在改变了脐橙叶片原有内生细 菌的菌群结构。从活体植物组织内直接检测才能得到真正的植物内生菌群落分布情况。通过分 析菌群的差异，有望找到与柑橘黄龙病菌生长相关的伴生菌。 关键词：黄龙病，赣南脐橙，内生细菌，16S rRNA 基因，菌群分布 Endophytic bacterial community in Gannan navel orange affected by huanglongbing * XIONG Da-Wei JIN Dan-Feng GU Bin-Tao HUANG Guo-Chang HUANG Xiao-Ping LIU Lan (Institute of Microbiology, Jiangxi Academy of Science, Nanchang, Jiangxi 330096, China) Abstract: [Objective] To analyze the endophytic bacteria in leaves of Huanglong disease affected and healthy Gannan navel oranges, and to compare the bacterial community under different culture conditions. [Methods] Candidatus Liberibacter was verified by PCR. Based on 16S rRNA gene high throughput sequencing, the diversity of endophytic bacteria in the leaves of diseased and healthy plants (each fi