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高斯软件介绍课件
题 目:高斯软件的简介指导老师:徐畅老师姓 名:马乃宇学 号:专 业:高分子化学与物理专业 ;Gaussian是一个量子化学软件包,它是目前应用最广泛的计算化学软件之一,Gaussian软件的出现降低了量子化学计算的门槛,使得从头计算方法可以广泛使用,从而极大地推动了其在方法学上的进展。 ; G98的功能和程序结构 1. 主要功能:;光谱计算;2.程序结构: ;常用模块的功能: L0—初始化模块; L1—读入输入,根据所给关键词确定将要使用的模块; L101,102,…—与构型优化和反应过渡态相关的模块; L202—输出距离矩阵、判断化合物点群及确定新的坐标系; L301,302…309—与基组和赝势有关模块; L310,…319—计算单及双电子积分模块; L401,402—SCF初始猜测模块; L502,503,508—SCF模块; L601,608—Mulliken布居以及自然键轨道分析模块; L701,702…—计算能量一阶和二阶导数模块; L9999—进程结束模块;;说明: 1.根据不同的任务,某些模块需重复调用多次; 2.通常耗时较多的模块有:L5,L7,L8,L9,L10,L11等,此外, L8~L11这些模块的执行对内存和硬盘的需求较大; 3.若L9999未能正常执行完毕,则表明计算过程存在问题,需 检查之; 4.可根据各个模块的功能,对g98程序进行简化,例如如果用 户通常只用g98进行能量计算,则可只保留L1~6和L9999模块 其它模块可以删除去。;G98输入文件的编写与使用;(1) L0命令部分: 该部分内容均以%打头,主要用于指定计算过程所需 内存,chk以及rwf文件名,其典型内容是: %mem=100mb(计算所需内存,若无,由Default.Rou指定) %chk=h2o(chk文件的名称为h2o.chk) %rwf=h2o(中间结果文件名称为h2o.rwf) (2)关键词部分: 该部分内容由一个或多个关键词组成,用于指定了计 算类型和计算输出的控制等。 (3)标题部分: 由一行文本组成,该内容是必需的。 (4)电荷及自旋多重度: 体系所带电荷以及自旋多重度S=2s+1=成单电子数+1 例如H2O,S=1;Ti原子的基态S=3;(5)分子构型描述部分: 有三种描述分子构型的方法: a.直角坐标系方法:(适用于全自由度优化情况) 格式为:元素符号 x y z 例如: O -0.464 0.177 0.0 H -0.464 1.137 0.0 H 0.441 -0.143 0.0 说明:1)元素符号大小写均可,也可直接用原子序数; 2)有时为了便于区别,可在元素符号后加一整数,如: O -0.464 0.177 0.0 H1 -0.464 1.137 0.0 H2 0.441 -0.143 0.0 3)x,y,z数值必须以小数格式输入: O -0.464 0.177 0 (?) O -0.464 0.177 0.(?) 4)g98的数据输入均为自由格式,即除了用空格来分隔 数据外,也可用逗号或混合使用;;b.内坐标(z-matrix)方法:(适用于构型的局部优化) 内坐标与直角坐标之间的区别在于,它侧重于从原子之间的 键连角度来描述原子间的相对位置,具体参数包括: 1)键长:( 需用两个原子描述) 即两个原子间的距离,注:该两个原子并非要具有化学直 观意义上的成键。此外,在默认情况下,键长单位为埃。 2)键角:(需用三个原子描述) 确定了二根键之间的夹角,默认单位为度,范围为-180~ 180deg之间,但二根键不能共线,即键角不能等于0和 ±180deg。 3)二面角:(需用四个原子描述) 二面角加上键长和键角就确定了四个原子
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