ImageJ在荧光照片分析中应用.pdfVIP

Image J 在显微成像中的应用介绍 1、关于Image J ImageJ 是一个基于java 的公共的图像处理软件，它是由 National Institutes of Health 开 发的。可运行于Microsoft Windows，Mac OS，Mac OS X，Linux，和 Sharp Zaurus PDA 等多 种平台。其基于java 的特点，使得它编写的程序能以applet 等方式分发。 ImageJ 能够显示，编辑，分析，处理，保存，打印8 位，16 位，32 位的图片，支持 TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS 等多种格式。ImageJ 支持图像栈（stack ）功能，即在一个 窗口里以多线程的形式层叠多个图像，并行处理。只要内存允许，ImageJ 能打开任意多的 图像进行处理。除了基本的图像操作，比如缩放，旋转，扭曲，平滑处理外，ImageJ 还能 进行图片的区域和像素统计，间距，角度计算，能创建柱状图和剖面图，进行傅里叶变换。 下载地址：/ij/download.html 2、Image 界面 界面分为：菜单栏，工具栏和状态栏。 菜单栏 菜单栏从左至右分别是：文件，编辑，图形，处理，分析，插件，窗口，帮助。 文件和 office word 等软件类似，主要有文件打开，关闭，保存等功能，比较特殊的一 个功能是恢复功能 （revert），可以直接回到上次保存过的状态。由于编辑菜单里的取消功能 （undo）只能回退一步，所以revert 有时会很有帮助。 编辑 Undo, Cut, Copy, Copy to system, Paste, Paste Control.., Clear, Clear Outside, Fill, Draw, Invert, Selection, Options. 图像 Type （可改变图片格式，如彩色变灰度）, Adjust, Show info, Properties, Color, Stacks, Hyperstacks, Crop, Duplicate.., Rename, Scale, Transform, Zoom, Overlay, Lookup Tables. 处理 Smooth, Sharpen, Find Edges, Find Maxima, Enhance Contrast, Noise, Shadows, Binary, Math, FFT, Filters, Batch, Image calculator, Subtract Backgroud, Repeat Command. 分析 Measure, Analyze Particles, Summarize, Distibution, Label, Clear Results, Set measurements, Set Scale, Calibrate, Histogram, Plot Profile, Surface Plot, Gels, Tools. 窗口和帮助 工具栏 工具栏从左至右分别是 4 种区域选择工具，直线选择工具，角度工具，点工具，魔棒， 文字，放大镜，拖手，颜色吸管，动作宏，菜单宏，绘图工具等（颜色吸管以后的内容可以 变化，通过点击最右边的 按钮选择需要的栏目。不同的按钮可以进行测量，画图，标记， 填充等操作。双击左键或单击右键可以扩展按钮的功能，如双击文字可以选择字体和大小等。 4 种区域选择工具分别是方形，椭圆形，多边形和任意形状。选择之后，这些区域可以 进行改变，分析，拷贝等。工具栏下的状态栏可以显示坐标信息。 直线工具：可以画直线、分段或任意形状的线（右键选择线的类型），双击该按钮可以 改变直线的宽度。选择分析测量Analyse →Measure(or Ctrl+M)可以记录线的长度，使用Edit →Draw (or Ctrl+D)可以使直线永久保留。 角度工具：点击角度按钮后可以画相交的直线可以测量形成的角度，在状态栏可显示， 选择分析测量Analyse →Measure(or Ctrl+M)，在结果窗口中显示角度。 点工具：当自动测量（A