基于仿射聚类的宏基因组序列物种聚类① - 计算机系统应用.PDF

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2017-09-06 发布于天津
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基于仿射聚类的宏基因组序列物种聚类① - 计算机系统应用.PDF

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年第卷第期计算机系统应用基于仿射聚类的宏基因组序列物种聚类聂鹏宇潘玮华徐云安徽省高性能计算重点实验室安徽合肥中国科学技术大学计算机科学与技术学院安徽合肥摘要随着下一代测序技术的迅猛发展宏基因组学已经成为新的研究热点宏基因组学序列聚类问题使用无参考的方法对包含多个物种的宏基因组序列进行有效分离为此提出一种结合相似度信息和结构信息的宏基因组物种聚类算法并引入仿射聚类来进行序列物种聚类实验数据表明该方法聚类精度高执行速度快我们也开发了基于该方法的宏基因组序列物种聚类软件关键词宏基因组学序列物种聚类仿射

2013 年第 22 卷第 11 期计算机系统应用基于仿射聚类的宏基因组序列物种聚类① 聂鹏宇 1,2, 潘玮华 1,2, 徐云 1,2 1(安徽省高性能计算重点实验室, 安徽合肥 230027) 2( 中国科学技术大学计算机科学与技术学院, 安徽合肥 230027) 摘要: 随着下一代测序技术的迅猛发展, 宏基因组学已经成为新的研究热点, 宏基因组学序列聚类问题使用无参考