探索应用反向对接技术研究蛋白激酶抑制剂选择性的可行性 - 药学学报.pdfVIP

758 药学学报 Acta Pharmaceutica Sinica 2009, 44 (7) : 758763 探索应用反向对接技术研究蛋白激酶抑制剂选择性的可行性 1, 2 2 1, 2 2* 刘廷林 , 谢焕章 , 魏于全 , 杨胜勇 ( 1. 四川大学生命科学学院, 四川 成都 610065; 2. 四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室, 四川 成都 610041) 摘要: 本文探索了应用反向对接技术研究激酶抑制剂选择性的可行性。首先通过收集晶体结构数据或使用 同源建模方法建立了包含422 个激酶的靶点三维结构数据库, 在此基础上建立了反向对接激酶靶点筛选方法, 并 对相关参数和打分函数进行了 选。最后, 选取了7 个典型的选择性激酶抑制剂作为例子, 用于测试该反向对接 激酶靶点筛选方法。结果表明, 这些激酶抑制剂的选择性作用靶点均具有较高的打分值 (打分值均排在所测试激 酶的35% 以内) 。本文的研究提示, 反向对接技术可以应用于激酶靶点虚拟筛选, 并进而应用于激酶抑制剂的选 择性研究。 关键词: 激酶抑制剂; 选择性; 分子对接; 反向对接 中图分类号: R916 文献标识码:A 文章编号: 05 13-4870 (2009) 07-0758-06 The feasibility of application of reverse docking method to the selectivity studies of protein kinase inhibitors 1, 2 2 1, 2 2* LIU Ting-lin , XIE Huan-zhang , WEI Yu-quan , YANG Sheng-yong (1. College of Lif e Science, Sichuan University, Chengdu 610065, China; 2. State Key Laboratory of Biotherapy, West China Hosp ital, Sichuan University, Chengdu 610041, China) Abstract: This investigation is to explore the feasibility of applying reverse docking method to the selectivity studies of protein kinase inhibitors. Firstly, a database that consists of 422 protein kinase structures was established through collecting the reported crystal structures or homology modeling. Then a reverse docking based method of protein kinase target