猪附红细胞体orf4蛋白的空间结构与b细胞抗原表位 - 中国农学通报.pdf

中国农学通报 2012,28(32):63-67 Chinese Agricultural Science Bulletin 猪附红细胞体ORF4 蛋白的空间结构 与B 细胞抗原表位预测 单 思，巴彩凤 （辽宁医学院实验动物中心，辽宁锦州121001） 摘 要：为了预测猪附红细胞体(Mycop lasma suis)ORF4 蛋白的空间结构和B 细胞抗原表位。选择 Genebank 序列号AJ504999 中ORF4 基因，应用生物信息软件和互联网在线程序分析ORF4 的氨基酸序 列预测二、三级结构、亲水性、柔韧性、抗原指数及表面可及性。结果表明：ORF4 蛋白二级结构没有α-螺 旋，其中柔性结构以β-转角为主，潜在的优势B 细胞抗原表位区段主要分布在28~34、54~61 氨基酸区 段。本研究预测了ORF4 蛋白空间结构和B 细胞抗原表位，为猪附红细胞体表位疫苗的设计研发提供 了指导意义。 关键词：猪附红细胞体；空间结构；B 淋巴细胞；表位；预测 中图分类号：R3 文献标志码：A 论文编号：2012-1431 Prediction of the Spatial Structure and B-cell Epitopes of Mycoplasma suis ORF4 Protein ShanSi,BaCaifeng (ExperimentalAnimalCenter,LiaoningMedicalUniversity,JinzhouLiaoning121001) Abstract: To predict the spatial structure and B-cell epitopes of Mycoplasma suis ORF4 protein. The secondarystructure,tertiarystructure,hydrophilicity,flexibleregion,antigenicindexandsurfaceprobability werepredictedthroughthenucleotidesequenceofAJ504999-ORF4wereanalyzedbybioinformaticssoftware andinternetroutine.TheresultsshowedthatthepotentialBcellantigenicepitopesofMycoplasmasuisORF4 proteinwerelocatedat 28-34, 54-61aa,whosethesecondarystructurewerewithout α-helixbutrichin β-pleatedsheet.PredictionofthespatialstructureandB-cellepitopesof Mycoplasma suis ORF4 protein mightlaidthebasisforstudiesofthedesignofepitopesvaccine. Key words: Mycoplasmasuis;spatialstructure;Blymphocyte;epitopes;prediction [2] 0 引言 径和致病机理认知极少 。而附红细胞体的病原分类 猪附红细胞体病(Ep erythrozoon suis)现又称猪嗜 备受争议，经16S rRNA 基因序列鉴定与支原体亲缘 血支原体病(Mycop lasma suis)[1] ，是由附红细胞体感染