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DNA条形码序列对不同品种金银花的鉴定
江苏农业科学 2013年第41卷第8期 -—·—43--——
崔志伟,王康才,郑 晖,等.DNA条形码序列对不同品种金银花的鉴定[J].江苏农业科学,2013,41(8):43—45
DNA条形码序列对不同品种金银花的鉴定
崔志伟 ,王康才 ,郑 晖 ,张彦南
(1.南京农业大学园艺学院,江苏南京210095;2.三明生物工程公司,江苏镇江212000)
摘要:采用DNA条形码序列对不同品种的金银花进行鉴定,为金银花的鉴定提供分子依据。主要选择ITS2和
psM —trnH序列进行评价 ,以扩增及测序成功率、变异位点数和 K一2一P距离等指标评价各序列的鉴定能力。此外,
基于MEGA4.0分析不同品种金银花序列种间K一2一P遗传距离并构建 NJ树。结果表明:不同品种金银花ITS2和
psbA—trnH序列的扩增及测序成功率均较高,扩增成功率为 100%,ITS2和psbA—tmH的测序成功率分别为72.7%、
91%,且两者均存在较多的变异位点,可以有效地区分金银花不同品种。说明ITS2和psbA—tmH可以作为鉴定金银
花不同品种的优势条形码组合。
关键词:DNA条形码;ITS2;psbA—tmH;金银花
中图分类号:$567.790.1 文献标志码:A 文章编号:1002—1302(2013)08—0043—03
金银花为忍冬科植物忍冬 (Lonicerajaponica)的干燥花蕾 鉴定为忍冬科忍冬属忍冬 (表 1)。试验材料种植于南京农业
或带初开的花,具有清热解毒、凉散风热之功效…,是国内市 大学牌楼实验基地。
场上的大宗药材。山东临沂地区和河南省新密县为道地产
表1 金银花品种采集地及 GenBank登录号
区,主要栽培品种有四季花、大毛花、鸡爪花等。近年来 ,由于
市场对金银花的需求不断增加,价格偏高,国内多地大面积引
种栽培 ,形成了许多金银花新产区。有研究发现,不同产地、
不同品种金银花药材品质差异较大,因此如何保证金银花药
材质量成为人们关注的问题。由于不同品种药材性状及原植
物形态比较相似 ,因而亟需新的技术鉴别不同品种。目前,关
于该项研究已有报道 ,如细胞学 (包括核型和染色体多态性)
和RAPD、ISSR等DNA分子标记方面的研究 。近年来 ,
DNA条形码技术发展较快,可直接利用 DNA序列进行物种
的鉴定,具有过程简便、结果可靠性强等特点,为药用植物的
鉴定提供了新的机遇 。。Chen等首先运用内转录第2间
隔区(internaltranscribedspace2,ITS2)对被子植物、裸子植物
注:“一”表示测序未成功;下表同。
等七大类群的6000多份药用植物样本进行 DNA条形码鉴
定,其物种水平鉴定效率达92.7% J。而众多学者推荐 的 1.2 DNA提取、PCR扩增、PCR产物纯化及测序
psbA—trnH序列在扩增成功率和物种识别率方面也有优良的 选取新鲜的叶片0.1g,经液氮研磨后,使用植物DNA提
表现_9 ,尤其在有花植物中展现 了较好 的种间鉴别价 取试剂盒 (天根生化科技有限公司)提取总DNA,PCR反应采
值 ,已被用于芍药属 、薯蓣属 等植物的种间鉴别研 用通用引物,反应体系及扩增程序均参照文献[15],进行1%
究,但未见关于金银花不同品种间鉴别的相关研究报道。因 琼脂糖凝胶电泳。随后用琼脂糖凝胶试剂盒 (天根生化科技
此,本试验研究上述2条DNA条形码在不同品种金银花中的 有限公司)对扩增 目的片段进行 回收,纯化后作为测序反应
差异,以期为不同金银花品种在分子水平上的鉴定提供依据。 的模板,送至上海英骏 (Invitrogen)生物技术公司进行双向测
序 ,测序引物同PCR引物。
1 材料与方法
1.3 数据分析
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