牦牛与黄牛肌肉差异蛋白质组及生物信息学分析 - 农业机械学报.pdfVIP

２０１７年 ４月 农 业 机 械 学 报 第 ４８卷 第 ４期 ｄｏｉ：１０．６０４１／ｊ．ｉｓｓｎ．１０００１２９８．２０１７．０４．０４１ 牦牛与黄牛肌肉差异蛋白质组及生物信息学分析 １ １ １ １ ２ ２ 左惠心 　韩　玲 　余群力 　牛克兰 　赵索南 　孔祥颖 （１．甘肃农业大学食品科学与工程学院，兰州 ７３００７０；２．海北州畜牧兽医科学研究所，海北 ８１０２００） 摘要：为了建立和优化牦牛肌肉组织蛋白质双向电泳（２ＤＥ）体系，结合生物信息学方法进行牦牛、黄牛差异蛋白质 通路分析。以牦牛背最长肌为实验材料，对不同裂解液成分、等电聚焦程序、染色方法进行研究，在最优 ２ＤＥ体系 参数下，对比分析牦牛、黄牛差异倍数大于２倍且达到显著水平（Ｐ＜００５）的 １９个蛋白质，通过基质辅助激光解 吸／电离飞行时间（ＭＡＬＤＩ ＴＯＦ／ＴＯＦ）质谱进行鉴定，并对鉴定结果进行了基因本体（ＧＯ）注释、京都基因与基因 组百科全书（ＫＥＧＧ）通路分析。结果表明，裂解液 ＩＩ、渐进式快速升压程序、改良的考染法获得的蛋白点匹配率高， 牦牛、黄牛２ＤＥ图谱蛋白点平均个数分别为４７９个和５５３个。通过比较牦牛和黄牛背最长肌中差异蛋白质可知， 所得到的差异蛋白质按照功能可分为代谢酶、结构蛋白和应激蛋白３大类。通过 ＫＥＧＧ分析可知，牦牛、黄牛差异 蛋白质主要集中在细胞代谢过程、碳水化合物代谢通路、遗传信息通路和能量代谢通路中，研究结果可为解释牦牛 和黄牛肌肉生物学特性和肉品质差异提供理论依据。 关键词：牦牛；黄牛；肌肉组织；双向电泳；差异蛋白质组学；生物信息学 中图分类号：ＴＳ２０７３ 文献标识码：Ａ 文章编号：１０００１２９８（２０１７）０４０３１３０８ ＰｒｏｔｅｏｍｉｃｓａｎｄＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓＡｎａｌｙｓｅｓｏｆＤｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙＥｘｐｒｅｓｓｅｄ ＰｒｏｔｅｉｎｓｉｎＹａｋａｎｄＢｅｅｆＣａｔｔｌｅＭｕｓｃｌｅ １ １ １ １ ２ ２ ＺＵＯＨｕｉｘｉｎ　ＨＡＮＬｉｎｇ　ＹＵＱｕｎｌｉ　ＮＩＵＫｅｌａｎ　ＺＨＡＯＳｕｏｎａｎ　ＫＯＮＧＸｉａｎｇｙｉｎｇ （１．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＦｏｏｄＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ＧａｎｓｕＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｌａｎｚｈｏｕ７３００７０，Ｃｈｉｎａ ２．ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＡｎｉｍａｌａｎｄＶｅｔｅｒｉｎａｒｙＳｃｉｅｎｃｅｏｆＨａｉｂｅｉＴｉｂｅｔａｎＡｕｔｏｎｏｍｏｕｓＰｒｅｆｅｃｔｕｒｅ，Ｈａｉｂｅｉ８１０２００，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｙａｋ（Ｂｏｓｇｒｕｎｎｉｅｎｓ）ｌｉｖｅｓａｔｐｌａｔｅａｕａｒｅａｏｆｍｏｒｅｔｈａｎ３５００ａｌｔｉｔｕｄｅｍｅｔｅｒ，ｉｎｔｈｉｓｃａｓｅ，ｙａｋ ｓｔｉｌｌｍａｉｎｔａｉｎｓｎｏｒｍａｌｐｈｙｓｉｏｌｏｇｉｃａｌａｃｔｉｖｉｔｙ．Ｂｅｓｉｄｅｓ，ｙａｋｍｅａｔｉｓｒｉｃｈｉｎｐｒｏｔｅｉｎａｎｄｌｏｗｉｎｆａｔ，ｗｈｉｃｈ ｄｏｅｓｎｏｔｃｏｎｔａｉｎａｎａｂｏｌｉｃｓｔｅｒｏｉｄｓ．Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓｒｅｓｅａｒｃｈｗｉｔｈｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｐｐｒｏａｃｈｃｏｍｂｉｎｅｄｗｉｔｈｔｈｅ ｅｓｔａｂｌｉｓｈｅｄｔｗｏｄｉｍｅｎｓｉｏｎａｌｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ（２ＤＥ）ｐｌａｔｆｏｒｍｓｗａｓｓｔｕｄｉｅｄｂｙｃｏｍｐａｒｉｎｇｙａｋｗｉｔｈｂｅｅｆ ｃａｔｔｌｅｍｕｓｃｌｅ．Ａｉｍｉｎｇｔｏｉｌｌｕｓｔｒａｔｅｔｈｅｃａｕｓｅｓａｎｄｐａｔｈｗａｙｏｆｄｉｆｆｅｒｅｎｔｍｅａｔｑｕａｌｉｔｉｅｓｉｎｙａｋａｎｄｂｅｅｆ ｃａｔｔｌｅ，ｅｓｔａｂｌｉｓｈｔｈｅｏｐｔｉｍａｌ２ＤＥｓｙｓｔｅｍａｎｄａｎａｌｙｚｅｐｒｏｔｅｉｎｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｐａｔｈｗａｙｓ