西施舌群体遗传结构及分化的RAPD分析解说.PDFVIP

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2017-07-19 发布于湖北
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西施舌群体遗传结构及分化的RAPD分析解说.PDF

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西施舌群体遗传结构及分化的RAPD 分析 1 2 2 1 1 1 , , , , , (1. , 222005; 2. , 350108) 摘要: 采用55 个随机引物对西施舌(Coelomactra antiquata)5 个群体, 即长乐(CL) 、启东(QD) 、连云港 (LYG) 、胶南(JN)和北海(BH)群体进行RAPD 扩增。用PopGen(Version1.32)软件进行遗传多样性分析。结果共筛选出12 个重复性好的引物, 得到88 条清晰稳定的条带, 扩增片段在100 bp~3 000 bp 之间, 其中引物S299 扩增的 600 bp 片段为长乐群体特有。多态位点比例为62.07%~78.26%(JN 、LYG 、BH 、 QD 、CL 群体分别为 78.26% 、77.05% 、72.58% 、70.05% 、62.07%), Shannon 指数为0.210 5~0.312 3 。群体间遗传距离为0.068 3~0.223 9, 其中长乐群体与其余4 个群体间的遗传距离为0.182 7~0.223 9, 4 个非长乐群体的遗传距离为0.068 3~0.136 7 。群体间遗传分化系数(Fst)为 0.313 01(P 0.05), 表明在整个遗传变异中群体间占31.30%。CL 群体与QD, BH, JN, LYG 群体间的遗传分化系数(Gst)分别为0.364 9, 0.344 8, 0.325 0, 0.309 0; 而非长乐群体之间的遗传分化系数为0.148 2~0.240 3; 以上数据显示长乐群体遗传分化最大。聚类结果显示, 启东和胶南群体首先聚为一支, 然后与北海群体聚在一起, 再和连云港群体相聚; 而长乐群体则单独形成一支。关键词: 西施舌(Coelomactra antiquata); 遗传结构; RAPD 中图分类号: Q951+ .3 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2011)02-0006-04 (Coelomactra antiquata) (JN)(LYG)(QD) , (Mollusca) (CL)(BH)5 (Bivalvia)(Veneroida)(Mactridae) 75%, 4°C , 30 DNA Taq (BBI) PCR [1], 10 , ( ) , 1.2 DNA 提取及浓度检测 , [2-3] ( ), , 20 60 , [4] [5] , 50~100 mg, , CTAB , [6-10], K , -, , TE DNA ,