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第六章生物信息学在蛋白质工程中的应用 - 中国农业大学研究生院
教 案 2012 ~ 2013学年 第 一学期 学 院、 系 室 生命科学学院 生物技术系 课 程 名 称 蛋白质工程 专业、年级、班级 2010级生工(1.2班) 主 讲 教 师 汪世华教授/袁军讲师 福 建 农 林 大 学 教案编写说明 教案又称课时授课计划,是任课教师的教学实施方案。任课教师应遵循专业教学计划制订的培养目标,以教学大纲为依据,在熟悉教材、了解学生的基础上,结合教学实践经验,提前编写设计好每门课程每个章、节或主题的全部教学活动。教案可以按每堂课(指同一主题连续1~4节课)设计编写。教案编写说明如下: 1、编号:按施教的顺序标明序号。 2、教学课型表示所授课程的类型,请在理论课、实验课、习题课、实践课及其它栏内选择打“√”。 3、题目:标明章、节或主题。 4、教学内容:是授课的核心。将授课的内容按逻辑层次,有序设计编排,必要时标以“*”、“#”“?”符号分别表示重点、难点或疑点。 5、教学方式、手段既教学方法,如讲授、讨论、示教、指导等。教学媒介指教科书、板书、多媒体、模型、标本、挂图、音像等教学工具。 6、讨论、思考题和作业:提出若干问题以供讨论,或作为课后复习时思考,亦可要求学生作为作业来完成,以供考核之用。 7、参考书目:列出参考书籍、有关资料。 8、日期的填写系指本堂课授课的时间。 福 建 农 林 大 学 教 案 编号:1 课时安排: 2 学时 教学课型:理论课√ 实验课□ 习题课□ 实践课□ 其它□ 题目(教学章、节或主题): 绪论 教学目的要求(分掌握、熟悉、了解三个层次): 掌握蛋白质工程研究的主要内容。 了解蛋白质工程发展史。 教学内容(注明:* 重点 # 难点 ?疑点): 蛋白质工程的物质基础二、蛋白质工程的原理 三、蛋白质工程的程序和操作方法 四、蛋白质工程的产生与发展 五、蛋白质工程的应用领域王大成2002.蛋白质工程北京:化学工业出版社 焦炳华,孙树汉2007.现代生物工程北京:科学出版社 廖湘萍2004.生物工程概论北京:科学出版社2007.基础分子生物学.北京:陶慰孙,李惟,姜永明. 1995. 蛋白质分子基础. 北京: 高等教育出版社蛋白质一、蛋白的生物学功能二、蛋白质类大分子的用蛋白质氨基酸与多肽链蛋白质氨基酸的结构、蛋白质氨基酸的一、第节 蛋白质结构的四、参与蛋白质与DNA间相互作用的结构域 第节 折叠组成蛋白质的氨基酸有?可以将它们分成几类?维持蛋白质三级结构和四级结构的有哪些? 为什么说蛋白质的一级结构决定它的高级结构?α-螺旋、β-转角等结构的形成与氨基酸序列有什么关系? 举例说明蛋白质的结构与功能之间有怎样的关系? 蛋白质的变性涉及哪些变化?哪些因素会导致蛋白质的变性? 王大成.2002.蛋白质工程.北京:化学工业出版社梁毅.2005.结构生物学.北京:科学出版社 王镜岩,朱圣庚,徐长法.2002.生物化学.北京:高等教育出版社王希成编著.2005生物化学(第2版). 北京:清华大学出版社,郭蔼光.200.基础生物化学. 北京:高等教育出版社 Reginald HG, Charles MG2005. Biochemistry. 北京高等教育出版社 ... 二、蛋白质分子设计的基础 (一)蛋白质生物功能的多样性 (二)蛋白质功能由其高级结构决定 (三)蛋白质的一级结构与其构象及功能的关系 (四)蛋白质空间构象与功能活性的关系 (五)结构生物学与生物信息学促进蛋白质分子设计 三、蛋白质分子设计的原则 四、蛋白质分子设计的程序 重点:基于天然蛋白质结构的分子设计。 难点:天然蛋白质设计原理及过程。 教学方式、手段、媒介: 讲授、教科书、多媒体 板书设计: 见课件 讨论、思考题、作业: 试述蛋白质分子设计的概念蛋白质分子设计与蛋白质工程的关系蛋白质分子设计的种类各自特点蛋白质分子设计的原理蛋白质分子设计的程序来鲁华等1993.蛋白质的结构预测与分子设计北京北京大学出版社 陶慰孙,李惟,姜永明1995.蛋白质分子基础北京高等教育出版社 俞庆森,朱龙观2000.分子设计导论北京高等教育出版社 [美] D.沃伊特J.G. 沃伊特C.W. 普拉特 著朱德煦郑昌学 主译2003.基础生物化学(上、下册)北京:科学出版社Kuhlman B, Dantas G. 2003. Design of a novel globular protein fold with atomic-level accuracy. Science, 1302-1364 Betz SF, Bryson JW, DeGrado WF. 1995. Native-like and structurally c
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