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第三部分基因组dna 提取

第三部分 基因组 DNA 提取 在生物学中,一个生物体的基因组是指包含在该生物的DNA (部分病毒是RNA )中的 全部遗传信息,又称基因体(genome )。基因组包括编码基因和非编码DNA 。更精确地讲, 一个生物体的基因组是指一套染色体中的完整的DNA序列。例如,生物个体体细胞中的二 倍体由两套染色体组成,其中一套DNA序列就是一个基因组。 生命是一种奇特的自然现象,生物体的生、长、病、老、死等一切生命现象都与基因密 不可分。基因是遗传的基本单元,是产生一条多肽链或功能RNA所必需的DNA片段。基因 通过复制把遗传信息传递给下一代,使后代出现与亲代相似的性状,也通过突变改变着自身 的生命特性,基因通过复制、转录、表达,完成生命繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生 理过程。因此,基因具有双重属性:物质性(存在方式)和信息性(根本属性)。 从细胞的结构上分析,基因存在于细胞核内,一个生物的所有基因的集合体组成基因组 DNA ,基因组DNA 与组蛋白紧密结合形成染色质,对于每一种生物来说,它所包含的基因 种类繁多,功能各异,要弄清每一基因的功能,首要的任务是要克隆出目的基因,得到高质 量的基因组 DNA 是实现这一任务的必要前提。从不同生物中提取基因组 DNA 是非常繁琐 的,提取质量的好坏直接影响到下游实验的进程。本公司针对不同生物、不同组织的结构特 点,设计出有针对性的基因组 DNA 提取试剂盒,操作简便,分离纯化的基因组 DNA 纯度 高,可直接应用于下游的实验,极大地方便了科研人员的研究工作。 离心吸附柱法提取:提取的基因组 DNA 一般在 30 ~ 50 kb 之间,能满足 RFLP 和 PCR 分析,在该长度上可保证酶切后产生 RFLP 片段(20 kb 以下) ,并可保证包含PCR 所扩增的 片段(一般 2 kb 以下) 。 磁珠吸附法:由于这种方法利用磁铁的吸附力分离纯化基因组DNA ,操作比较轻柔, 得到的 DNA 片段较长,可达 100 kb 以上,因此适合构建基因组文库等要求较高的后续实验。 基因组 DNA 提取的原理 DNA 是由脱氧核苷酸组成的长链,DNA 与组蛋白构成核小体,核小体缠绕成中空的螺 旋管状结构,即成染色质丝,染色质丝再与许多非组蛋白形成染色体(图 1)。染色体存在 于细胞核中,外有核膜及细胞膜。从组织中提取 DNA 必须先将组织分散成单个细胞,然后 破碎细胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与 DNA 结合的组蛋白与非组蛋白。基因 组 DNA 的纯化一般是通过裂解液处理样品,裂解细胞,将DNA 从细胞核中释放出来,并 使 gDNA 与蛋白质分开,DNA 仍留在上清液中,通过后续的异丙醇沉淀将 DNA 沉淀分离 出来。 DNA 与蛋白质 经数次缠绕 同源染色体 图 1:基因与染色体结构示意图 基因组 DNA 提取的原则与步骤 在基因组 DNA 提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离 基因组 DNA 时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓,以 保证得到较长的 DNA 。一般来说,构建基因组文库,初始DNA 长度必须在 100 kb 以上, 否则酶切后两边都带合适末端的有效片段很少。而进行 RFLP 和 PCR 分析,DNA 长度可短 至 50 kb,在该长度以上可保证酶切后产生RFLP 片段(20 kb 以下) ,并可保证包含PCR 所扩 增的片段(一般 2 kb 以下) 。 不同生物(植物、动物、微生物)的基因组 DNA 的提取方法有所不同,不同物种或同 一物种的不同组织因其细胞结构及所含的成分不同,分离方法也有差异。在提取某种特殊组 织的 DNA 时必须参照文献和经验建立相应的提取方法, 以获得可用的DNA 大分子。尤其 是组织中的多糖和酚类物质对随后的酶切、PCR 反应等有较强的抑制作用,因此用富含这 类物质的材料提取基因组 DNA 时,应考虑除去多糖和酚类物质。 样品的收集和保存 请尽量使用新鲜的组织材料,采集样品如果不马上用于提取实验,请置于-20℃或者 -70℃以下存放。期间应避免反复冻融,使用反复冻融或长时间未低温冷藏的样品进行DNA 的提取,所提取的D

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