结核分枝杆菌比较基因组学研究进展.pdfVIP

科技通报科技通报 第29卷第9期 Vol.29 No.9 2013年9月 BULLETINOFSCIENCEANDTECHNOLOGY Sep. 2013 结核分枝杆菌比较基因组学研究进展 1，2 1，2* 2，3* 池水晶 ，宝福凯 ，柳爱华 （1.昆明医科大学病原生物学与免疫学系，昆明650031；2.昆明医科大学热带医学研究所，昆明650031； 3.昆明医科大学生物化学与分子生物学系，昆明650031） 摘 要：H37Rv全基因组测序的完成，使得结核分枝杆菌遗传背景不清的状况得到改善。随后，结核分 支杆菌等大量模式生物基因组完成测序，产生了丰富的生物信息资源，而随之发展起来的BLAST 、 FASTA和CLUSTALW等生物信息技术为比较基因组学研究提供强有力的支撑。通过结核比较基因组 学研究为结核分支杆菌的进化和分类，找寻结核毒力因子，及筛选抗结核药物靶标提供良好的契机。 关键词：结核分枝杆菌；基因组；比较基因组学；进化；分类；毒力因子；药物靶标 中图分类号：R378.91 文献标识码：A 文章编号：1001-7119（2013）09-0040-06 RecentProgressonComparativeGenomicsofMycobacteriumtuberculosis 1,2 1,2* 2,3* ChiShuijing ，BaoFukai ，LiuAihua （1.DepartmentofPathogenBiologyandImmunology,KunmingMedicalUniversity,Kunming650031，China; 2.TheInstituteforTropicalMedicineKunmingMedicalUniversity,Kunming650031，China; 3.DepartmentofBiochemistryandMolecularBiology,KunmingMedicalUniversity,Kunming650031，China） Abstract：ThewholegenomesequencingofH37Rvhasbeencompleted,sothat theuncleargenetic backgroundoftheMycobacteriumtuberculosishasbeenimproved.Subsequently,awealthofbiological information resources generated,because of a large number of model organisms genome of Mycobacterium tuberculosis sequencing completed, as BLAST, FASTA and CLUSTAL W et.al. developed , Bio IT provides a strong support for comparative genomics research. Mycobacterium tuberculosis comparative genomics research provide a good chance to find the Evolution and classificationofMycobacteriumtuberculosis,tuberculosisvirulencefactors,andanti-TBdrugtarget