八肋游仆虫胞质核糖体蛋白基因序列特征分析 - 水生生物学报.pdfVIP

第 41 卷 第 3 期 水 生 生 物 学 报 Vol. 41, No. 3 2 0 1 7 年 5 月 ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA M a y , 2 0 1 7 doi: 10.7541/2017.84 八肋游仆虫胞质核糖体蛋白基因序列特征分析 王软林 赵雪梅 张志云 梁爱华 ( 山西大学生物技术研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室, 太原 030006) 摘要: 为了探讨八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)核糖体蛋白基因的数目及其结构的特殊性, 研究通过生物 信息学方法, 对八肋游仆虫胞质核糖体蛋白进行了系统的分析。共鉴定得到98个基因编码78种不同的胞质核 糖体蛋白。其中19种胞质核糖体蛋白基因发生了复制, 尽管都是有功能的, 但其中一个基因的表达受到限 制。通过与高等真核生物比较, 我们发现: 八肋游仆虫核糖体蛋白eS30缺失了N端的类泛素结构域, eL6缺失 了N 端的Ribosomal_L6e_N 结构域。另外, 不同于其他高等真核生物, 八肋游仆虫酸性核糖体磷酸化蛋白 uL10为碱性蛋白。研究为进一步探讨低等真核生物核糖体的组装及功能奠定了基础。 关键词: 八肋游仆虫; 核糖体蛋白; 序列分析 + 中图分类号: Q344 .1 文献标识码: A 文章编号: 1000-3207(2017)03-0661-10 核糖体是最古老也是最普遍的生命复合体, 它 八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)是一种淡 [9] 能够将遗传信息(mRNA)转化为执行各种生命功能 水纤毛虫, 体内含有一个大核和一个小核 。除了其 的蛋白质, 是细胞中催化蛋白质合成的重要细胞 特殊核结构外, 在基因表达调控方面游仆虫也有特 器。虽然进化程度越高, 生物的核糖体越复杂, 但 殊之处。在游仆虫中存在终止密码子重新分配的 [1] 现象, 即UAA和UAG作为终止密码子, 而UGA编码 其结构和功能在进化上是保守的 。所有的核糖体 [10] [11] 都由一组核糖体蛋白(Ribosomal protein, RP) 围绕