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吉尔吉斯斯坦伊塞克湖一处土壤样品细菌多样性①
第36卷 第4期 Vol.36 No.4
2013年7月 ARID LAND GEOGRAPHY July 2013
吉尔吉斯斯坦伊塞克湖一处土壤样品细菌多样性①
王 宁 , 包慧芳 , 古丽尼莎·沙依木 , 王 炜1 1 1 2
(1 新疆农业科学院微生物应用研究所,新疆 乌鲁木齐 830091; 2 中国科学院新疆分院,新疆 乌鲁木齐 830011)
摘 要: 采用纯培养方法从吉尔吉斯斯坦共和国伊塞克湖一处温泉旁的土壤中分离到32株细菌,
通过ARDRA分析后得到不同的类群,从各个类群中随机选取1个代表菌株进行16SrDNA序列测
定和系统发育的分析。结果表明:分离的菌株分布在假单胞菌属(Pseudomonas)、类芽孢杆菌属
(Paenibacillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)、Lysinibacillus、溶杆菌
属(Lysobacter)、短芽孢杆菌属(Brevibacillus)、根瘤菌属(Rhizobium)、变形杆菌属(Proteus)等9个
属,且部分菌株的16SrDNA序列同源性低于97%,可能是潜在的新种。结果揭示了该样点可培养
细菌种群的多样性及独特性。
关 键 词: 可培养细菌;ARDRA;16SrDNA;吉尔吉斯斯坦
中图分类号: S154.38 文献标识码:A 文章编号:1000-6060(2013)04-0609-06(609~614)
吉尔吉斯斯坦共和国(简称吉国)地处中亚中心 1 材料与方法
位置,国土面积19.8×10 km ,93%的国土面积为山4 2
地,全国平均海拔2750m,其中高达3000~4000m 1.1 材料
[1] 1.1.1 主要试剂和仪器 PCR反应试剂盒购自宝
的地区占全国的1/3,因此素有“山地之国”之称 。
因该国位于欧亚大陆腹地、远离海洋、处于广袤沙 生物工程(大连)有限公司,PCR扩增引物合成及样
漠边缘的地理位置以及复杂的高山地貌,决定了其 品测序由上海生工生物工程技术服务有限公司完
大陆性气候强、降水不多、空气干燥、云量少、太阳辐 成。离心机为EppendorfCentrifuge5417R,PCR仪为
®
射强、夏季炎热干燥、冬季比较寒冷且昼夜温差大。 EppendorfMastercycler ep。
伊塞克湖海拔1608m,是吉国境内最大的自 1.1.2 样品来源 2012年10月,土壤样品采自吉国
然景观和吉尔吉斯斯坦最大的高山湖泊,湖水面积 伊塞克湖一处温泉附近(42°27′N,78°32′E)的草甸
6236km (占吉国湖泊总面积的91%),共有湖泊2 地,随机选取5处深度为3~20cm的土壤样品,混匀
204个,分布有森林、草原、草甸、荒漠半荒漠等植被 后装入无菌容器内,4 ℃保存备用。
[2] 1.1.3 培养基 牛肉膏蛋白胨培养基、营养琼脂培
类型 。目前,对该地区的研究主要集中在气候、水
[3]
资源、地形地貌、生态环境等方面,尚未见关于其特 养基和高氏一号培养基 。
定生境下土壤微生物多样性的报道。 1.2 方法
[4]
本文采用可培养方法对伊塞克湖一处未命名
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