基于膜计算的生物系统建模方法.pdfVIP

第 卷 第 期 ２ ５６ 数学建模及其应用 Ｖｏｌ．２Ｎｏ．５６ － － 年 月 ＭａｔｈｅｍａｔｉｃａｌＭｏｄｅｌｉｎ ａｎｄＩｔｓＡ ｌｉｃａｔｉｏｎｓ ２０１３ １１ 　 ｇ 　 　 ｐｐ Ｎｏｖ．２０１３ 　 　　　 　 檺 殣檺檺檺檺檺檺殣 檺 檺 专题综述 殣 檺 檺檺檺檺檺檺殣 基于膜计算的生物系统建模方法 ， ， 孔元 陈智华 徐金榜 （ ， ） 华中科技大学自动化学院 湖北武汉 ４３００７４ ： 、 ， ， ， 摘 要 膜计算的研究旨在借鉴细胞 组织 以及人类大脑存储与处理信息的方式 构造高性能生物计算模型 统称 　 。 ， ， ， 为膜系统 膜系统具有分布式结构 并行计算的运行方式 以及扩展性强与容错性高的特点 为生物系统建模从生 。 、 ， 物计算角度提供了全新的工具 主要介绍代谢膜系统 随机膜系统和多重环境的概率膜系统的概念 概述了这 ３ 类膜系统在生物系统建模中的应用及其相应的仿真软件。 ： ； ； ； ； 关键词 自然计算 膜计算 膜系统 生物系统建模 仿真 中图分类号： 文献标志码： 文章编号： （ ） ＴＰ３０１ Ａ ２０９５３０７０２０１３ 　　　 　　　 － － － － ０ 引言 　 ， 。 ， 从计算模型的研究历史来看 大自然为人类发展计算模型提供了丰富的思想源泉 年 月 受细 １９９８ １１ ， 、 、 胞的结构与功能启发 欧洲科学院院士 罗马尼亚科学院院士 国际信息科学院院士Ｇ．Ｐǎｕｎ教授在芬兰图 ［ ］ １ 。 ， 尔库计算机研究中心的研究报告中提出了膜计算的概念 膜计算研究的计算模型称为膜系统 其研究旨 、 、 ， （ 在从单个细胞 高级组织器官的功能 人类大脑以及其他生命结构中 抽象出可以执行计算 以特定的方式编 ，