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Gaussian09模拟ECD光谱确定天然产物绝对构型（YJH）Gaussian模拟溶剂下的ECD光谱已知:某天然产物的平面结构如下图，通过NMR确定了1，2位的相对构型；目的：通过Gaussian计算ECD光谱，确定该化合物的绝对构型。该化合物在甲醇中的CD谱见下图。?首先我们会在GV中将构建这个化合物，并对化合物的结构进行优化。这个化合物有两个手性中心，分别为图中1,2所指的位置。事先已经得知OH和Ar的朝向相反，所以若连接Ar的手性碳为S构型，则连接OH的手性碳为R，称为情况1.若连接Ar的手性碳为R构型，则连接OH的手性碳为S构型，称为情况2.?在情况1下，构建的输入文件如下：====================================================%nprocshared=16%mem=32GB%chk=/home/xs/yjh/cdtry2-1C.chk# opt freq b3lyp/6-31g(d) scrf=(solvent=methanol)[No Title]?0 1?C???????????????? -5? -1?? 0C???????????????? -5? -2?? 0C????????????? ???-4? -3?? 0C???????????????? -3? -2?? 0C???????????????? -3? -1?? 0C???????????????? -4? -0?? 0C???????????????? -1? -3?? 0C???????????????? -0? -2?? 0C???????????????? -0? -1? -0O???????????????? -1? -0? -0C???????????????? -4?? 0?? 0C???????????????? -3?? 1? -0C???????????????? -3?? 3? -0C???????????????? -4?? 3? -0C???????????????? -5?? 2?? 0C?????????????? ??-5?? 1?? 0O???????????????? -6? -0?? 0O???????????????? -4? -4?? 0O????????????????? 0? -3? -0C????????????????? 0? -0? -0C????????????????? 0?? 0? -1C????????????????? 1?? 1? -1C????????????????? 2?? 1? -0C????????????????? 2?? 0?? 0C????????????????? 1? -0?? 0O????????????????? 3?? 2? -0O????????????????? 2.3314
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