生物信息学讲座-2016-7-15-未删减版教材.pptx

亚 源 制 帽 网 站 建 设 ;生物信息学的发展历程;3;（二）基因组时代的生物信息学;专业的抗体顾问----巴傲得;（三）后基因组时代的生物信息学;后基因组时代研究对象的多层次性;8;功能基因组学发展趋势;功能基因组系统学; 传统生物学关注的是一个一个的通路，而后基因组生物信息学则希望研究各个通路之间的相互作用，构成一个复杂的相互作用网络，从而从更高的层面上理解生命过程。通俗地说：传统生物学看到的是树木，后基因组生物信息学则看到的是森林。;整合多层次数据在网络层面研究细胞内复杂生物过程的基本思想。;13;生物信息学系统化概图;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;1、为什么要进行文献阅读？; 每一篇学术论文都是一个Story，Story写的越精彩看的人越多，引用率就越高。 要高度重视学术论文中引言部分的文献综述，对某个领域代表性文献作较全面的综述是学术论文的重要组成部分。通常引言部分能对所研究问题的动态和有关成果作较系统的介绍和评述，要突出直接的相关性、不可遗漏经典文献和重要的近期文献。对他人工作的评述要准确到位、简练、客观，因为要尊重前人成果。 引言部分能够反映研究工作的扎实基础，研究问题的重要性，以及高的研究起点。 ;3）了解相关理论、技术手段和研究方法的需要 ???针对你自己的研究方向,找相近的论文来读,从中了解本研究领域有关理论的进展和突破，理解文献中回答什么问题,又是通过哪些技术手段来证明,有哪些结论? 从这些文献中,了解研究思路,逻辑推论,学习和掌握相关的技术方法. ;2、文献阅读的一些建议;把这篇论文与其他论文做个比较：它和其他论文比较起来，做得好吗？一样有意义吗？一样可信吗？作者的身分有没有影响你对文章的评价？就论文的主题和实验数据而言，这个杂志是不是发表它的最好的选择？ 论文写得好吗？数据表达得清楚吗？如果没有其它的数据，给出的数据图是不是足够清晰，容易理解？论文把研究背景都说明白了吗？ 预料一下研究的下一步工作：最后研究可能会进行到哪里？ 在讨论的时候，也可以这样想：我的工作、我的论文和它比起来怎样呢？我希望别的作者做的事情我自己做到了吗？;科学研究的一般工作流程;专业的抗体顾问----巴傲得;Web of Knowledge 知识平台网址：;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;Web of Science能帮助我们做什么? 检索 分析 管理 写作 ;Web of Science;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;2004;引文检索;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;Endnote Web 边写作边引用;文献管理软件Endnote使用心得及简介;科研工作者必备能力 获取信息的能力----文献有哪些信誉好的足球投注网站引擎的使用 管理信息的能力----文献管理软件的使用 分析信息的能力----文献分析软件的使用 EndNote由Thomson Reuters公司开发，占有率约为50%，使用广泛(中文文献不够友好，与windows MS office word高度兼容) NoteExpress适合中文文献信息管理 LaTex 适合Linux环境使用。;EndNote软件使用前的一些基本概念;安装Endnote X7后，打开应用程序，界面如下所示：; 点击菜单栏中的File按钮，在下拉菜单中可以单击New选项，新建一个库文件，或者直接使用安装时默认的库文件即可;Endnote界面简介;在我们有哪些信誉好的足球投注网站文献前可以先进行分组，便于我们以后查找文献;本地库有哪些信誉好的足球投注网站;以在线数据库为例简单介绍文章的检索——数据库的选择;;;右击选中的文献，将其加入选中的数据库中;文献的插入;待参考文献全部插入结束，开始设置参考文献的格式;其他有用操作;利用endnote进行统计分析;二、基因结构与调控元件预测;真核生物基因结构示意图;基因结构预测主要包括预测基因组中的基因位点、开放性阅读框架（ORF）、翻译起始位点和终止位点、内含子和外显子区域、启动子、剪接位点、选择性剪接模式以及蛋白质编码序列等。;原核生物基因的各种信号位点（如启动子和终止子信号位点）特异性较强且容易识别，因此相应的基因预测方法已经基本成熟。;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;专业的抗体顾问----巴傲得;核苷酸序列中蕴涵着丰富的信息，对于真核编码基因序列的分析，主要是围绕如下内容进行：