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PCR常见问题、原因分析与其对策
PCR技术常见问题、原因分析及其对策
淮北师范大学生命科学学院
朱秀云
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内容
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PCR技术的简介
什么是PCR?
PCR: Polymerase chain reaction,即聚合酶链反应
是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术
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PCR技术的简介
PCR技术的发展历史
关于PCR 的文章首次由美国科学Kary Mullis等
人在 《Science》杂志上发表
1989 《Science》杂志报道了耐热性DNA多聚酶 Taq酶(生活在温泉中的水生嗜热杆菌内提取到的一种耐
热的DNA聚合酶 )的发现,预示着分子时代的到
来。12月《Science》杂志将PCR和它所使用的聚
合酶命名为第一个“年度分子”。
1993 Kary Mullis 因PCR的发明获得诺贝尔化学奖。
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PCR技术的简介
PCR原理的简介
PCR的扩增过程模拟体内DNA的天然复制过程,利用一种从水生栖热菌 Thermus Aquaticus ( Taq )中分离出的具有热稳定性的DNA 聚合酶,及碱基互补配对原则。通过高温变性、低温退火和中温延伸三个阶段的多次循环,最终使基因扩增形成特异区段的DNA带,实现DNA在体外的特异性扩增。
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PCR技术的简介
重复1~3步
25~35轮
目的DNA片段
扩增100万倍以上
DNA双螺旋
DNA单链
与引物复性
DNA变性
形成2条单链
子链延伸
DNA加倍
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PCR的常见问题、原因分析及对策
PCR常见问题
无扩增产物
非特异性扩增
拖尾
假阳性
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PCR的常见问题、原因分析及对策
PCR常见问题之一:无扩增产物
现象:正对照有条带,而样品则无;
模板:含有抑制物,含量低
Buffer对样品不合适
引物设计不当或者发生降解
反应条件:退火温度太高,延伸时间太短
原因
对
策
纯化模板或者使用试剂盒提取模板DNA或加大模板的用量
更换Buffer或调整浓度
重新设计引物(避免链间二聚体和链内二级结构)或者换一管新引物
降低退火温度、延长延伸时间
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PCR的常见问题、原因分析及对策
PCR常见问题之二:非特异性扩增
现象:PCR扩增后出现的条带与预计的大小不一致,或大或小,或者同时出现特异性扩增带与非特异性扩增带。
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PCR的常见问题、原因分析及对策
非特异性扩增
引物特异性差
模板或引物浓度过高
酶量过多
Mg2+浓度偏高
退火温度偏低
循环次数过多
原因
对
策
重新设计引物或者使用巢式PCR
适当降低模板或引物浓度
适当减少酶量
降低镁离子浓度
适当提高退火温度或使用二阶段温度法
减少循环次数
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PCR的常见问题、原因分析及对策
PCR常见问题之三:拖尾
现象:产物在凝胶上呈Smear状态。
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PCR的常见问题、原因分析及对策
拖尾
模板不纯
Buffer不合适
退火温度偏低
酶量过多
dNTP、Mg2+浓度偏高
循环次数过多
原因
对
策
纯化模板
更换Buffer
适当提高退火温度
适量用酶
适当降低dNTP和镁离子的
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