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e-Science 技术 TECHNOLOGY 非编码RNA组科学数据库: NONCODE 1,2 1 1 1 任菲 何顺民 刘长宁 赵屹 1. 中国科学院计算技术研究所前瞻实验室,北京 100190 2. 中南大学,湖南 410083 摘 要:NONCODE科学数据库是中国科学院计算技术研究所生物信息学研究组和中国科 学院生物物理研究所生物信息学实验室共同开发和维护的一个提供给科学研 究人员分析非编码RNA基因的综合数据平台。自从其2005年发布以来,非编码 RNA基因的数量飞速增长[1-3],而且人们也逐步认识到非编码RNA基因在大多数 物种中都发挥着重要的调控作用[4]。《Science》杂志在2005年1月的期刊中 曾给予NONCODE数据库较高的评价和推荐。2006年,ISI Web of Knowledge 邀请收录NONCODE科学数据库;2007年,中国国家医药卫生科学数据共享平台 收录了NONCODE科学数据库。目前在NONCODE 2.0数据库中,非编码RNA基因 的数量大约为20多万条目,其中包括了microRNA,Piwi-interacting RNA和 mRNA-like ncRNA等。同时,在NONCODE中的非编码RNA基因数据分析平台中, 还为研究人员提供了BLAST序列比对服务,非编码RNA基因在基因组中定位以 及它们的上下游相关注释信息的浏览服务。研究人员可以通过http://www. / 或者 / 网站来访问该数据 平台。 关键词: 非编码RNA;科学数据库;RNA组学 8 e-Science 2009年 TECHNOLOGY e-Science 技术 Non-coding RNA Scientific Database: NONCODE 1 1,2 1 1 Ren Fei , He Shunmin , Liu Changning , Zhao Yi 1. Center for Advanced Computing Research, Institute of Computing Technology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100190,China 2. Central South University, Changsha, Hunan Province 410083, China Abstract: The NONCODE database is an integrated knowledge database designed for the analysis
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