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16(S):35-42 COM. on C. A. 4:e6, 2010 ª 现代人类学通讯 第四卷 2010 年 Communication on Contemporary Anthropology Vol. 4 专题综述 Three Revolutionary Changes in the Development of Ancient DNA Analysis Techniques WANG Chuanchao, LI Hui MOE Key Laboratory of Contemporary Anthropology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200433, China Abstract: Ancient DNA (aDNA) is the DNA recovered from post mortem archaeological or historical specimens. With the widespread adoption of molecular biological techniques over the past two decades, the study of aDNA has evolved from the retrieval of small fragments of mitochondrial DNA of extinct species to entire genome sequencing of Neanderthals. These techniques, including molecular cloning, polymerase chain reaction (PCR), next generation DNA sequencing techniques, primer extension capture (PEC), and array hybridization capture, have solved numerous cases that had been mysteries for thousands of years. Keywords: Ancient DNA, Molecular cloning, Polymerase chain reaction (PCR), Next generation DNA sequencing techniques, Primer extension capture (PEC), Array hybridization capture (AHC). 古 DNA 分析技术发展的三次革命 王传超, 李辉 复旦大学现代人类学教育部重点实验室，上海 200433 摘要：古DNA研究以分子生物学技术为基础，以古生物的DNA为研究对象，是一个新兴领域。20余年来，古 DNA实验技术不断发展。分子克隆、PCR 、下一代测序技术、引物延伸捕获和芯片杂交捕获等扩增和测序技 术的不断涌现，分别引领了古DNA研究的三次革命，极大推动古DNA研究发展、成熟。从229bp斑驴的mtDNA 到尼安德特人基因组草图，古DNA研究取得一系列的突出成果, 解开了众多千万年来的谜题。 关键词：古DNA ；分子克隆；聚合酶链式反应(PCR) ；下一代测序技术；引物延伸捕获(PEC) ；芯片杂交捕获 (AHC) 古DNA(ancient DNA)是指从考古遗迹 1984年，Higuchi等[5]从保存约140年的 和古生物化石标本中获取的古生物的遗传物 斑驴(Equus quagga quagga ，已于1883年灭绝) 质[1] 。古DNA研究是以分子生物学技术为基 的 皮 肤 中 得 到 了 229bp 的 线 粒 体 DNA 础发展起来的一个新兴领域，通过古DNA研 (mitochondrial DNA，mtDNA)序列，并通过 究能够分析古代生物的谱系、分子演化理论、 与其近亲——马、驴、斑马的相关mtDNA序 人类的起源和迁移、动植物的家养和驯化过 列进行比对, 得出斑