生物化学 3 核酸化学.ppt

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生物化学3核酸化学要点

3.4 DNA的高级结构 3.4.1 环状DNA的超螺旋结构 DNA双螺旋的进一步扭曲构成三级结构——超螺旋(染色体包装) 3.4 DNA的高级结构 3.4.2 真核生物染色体的结构 多级螺旋模型 DNA → 核小体 → 螺线管 →超螺线管 →染色单体 2nm 11nm 30nm 400nm 2-10μm 双螺旋 一级包装 二级包装 三级包装 四级包装 压缩倍数 7 6 40 5 (共8400) 染色体包装示意图 包装 包装 包装 包装 3.5 DNA和基因组 3.5.1 基因与基因组的慨念 基因------DNA分子中最小的功能单位。 基因组------生物体所含的全套遗传物质。 基因组学------研究基因组的结构、功能及表达产物的学科。 3.5.2 基因和细菌基因组的特点 3.5.3 真核生物基因组的特点 (1)基因组较大 (2)不存在操纵子结构 (3)存在大量重复序列 (4)有断裂基因 (1)基因组较小 (2)大部分用于编码蛋白质 (3)存在操纵子结构 RNA是单链分子,因此,在RNA分子中,并不遵守碱基种类的数量比例关系,即分子中的嘌呤碱基总数不一定等于嘧啶碱基的总数。 RNA分子中,部分区域也能形成双螺旋结构,不能形成双螺旋的部分,则形成突环。这种结构可以形象地称为“发夹型”结构。 在RNA的双螺旋结构中,碱基的配对情况不象DNA中严格。G 除了可以和C 配对外,也可以和U 配对。G-U 配对形成的氢键较弱。不同类型的RNA, 其二级结构有明显的差异。 tRNA中除了常见的碱基外,还存在一些稀有碱基,这类碱基大部分位于突环部分。 3.6 RNA的结构与功能 RNA的一级结构------ RNA的高级结构------ —RNA分子是含短的不完全螺旋区的多核苷酸链。 3.6.1 tRNA tRNA约占RNA总量的15%,主要作用是转运氨基酸用于合成蛋白质。tRNA分子量为4S,1965年Holley 测定AlatRNA一级结构,提出三叶草二级结构模型。 tRNA分子具有以下特点: 分子量25000左右,大约由70-90个核苷酸组成,沉降系数为4S左右。 分子中含有较多的修饰成分。 3’ -末端都具有CpCpAOH的结构。 主要特征: 1.四臂四环:氨基酸臂:3′端有CCAOH的共有结构;反密码子环:环上的反密码子与mRNA相互作用; 二氢尿嘧啶(D)环:其上有二氢尿嘧啶(D),与识别酶有关; TψC环:含有T和ψ,与识别核糖体有关; 可变环:其上的核苷酸数目可以变动; 2.含有修饰碱基和可变核苷酸,修饰碱基约为10%。 tRNA的二级结构——三叶草型 3.6 RNA的结构与功能 在三叶草型二级结构的基础上,突环上未配对的碱基由于整个分子的扭曲而配成对,目前已知的tRNA的三级结构均为倒L型 tRNA的三级结构-倒 L型 倒“L”型 核糖体RNA( rRNA) 占细胞RNA总量的80%,与蛋白质(40%)共同组成核糖体。 原 核 生 物 真 核 生 物 核糖体 rRNA 核糖体 rRNA 70S (30S+50S) 16S、5S、23S 80S (40S+60S) 18S、5S、5.8S、28S ? 3.6 RNA的结构与功能 3.6.2 rRNA mRNA约占细胞RNA总量的3~5%,是蛋白质合成的模板。真核生物mRNA的前体在核内合成,包括整个基因的内含子和外显子的转录产物,形成分子大小极不均匀的hnRNA。 3.6 RNA的结构与功能 3.6.3 mRNA和hnRNA 3.6.4 snRNA(小分子RNA)和snoRNA(核仁小RNA) 3.6.5 asRNA(反义RNA)和RNAi(RNA干扰) 3.6.6 非编码RNA的多样性 真核细胞mRNA的3’ -末端有一段长达200个核苷酸左右的多聚腺苷酸(polyA),称为 “尾结构” ,5’ -末端有一个甲基化的鸟苷酸,称为 “帽结构” 。 是两性电解质,呈酸性; DNA白色纤维状固体,RNA白色粉末; 微溶于水,不溶于有机溶剂; DNA-蛋白,溶于1mol/L Nacl ,低盐不溶;RNA-蛋白,溶于0.14mol/L Nacl ,高盐不溶。 DNA在PH4.2时;RNA在PH2-2.5时溶解度最低。 D-核糖+苔黒酚(甲基间苯二酚) 绿色化合物 D-脱氧核糖+二苯胺 蓝紫色化合物 3.7 核酸的性质 3.7.1 一般理

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