妊娠期糖尿病孕妇大网膜下脂肪组织全基因组 DNA 甲基化研究.pdfVIP

http ∕∕www chinagp net E-mail zgqkyx@chinagp net cn 1·59 · ·论著· 妊娠期糖尿病孕妇大网膜下脂肪组织 全基因组 DNA 甲基化研究 1* 2 1 1 1 1 钱 源 ，孙 浩 ，肖 雪 ，祁文瑾 ，张 兰 ，马润玫 【摘要】 背景 大网膜下脂肪组织与妊娠期糖尿病（GDM）密切相关，目前，关于GDM孕妇大网膜下脂肪组 织全基因组DNA 甲基化研究较少。目的 研究GDM孕妇和无GDM孕妇大网膜下脂肪组织全基因组DNA 甲基化差异， 为寻找GDM可能的致病基因提供线索。方法 选取2012年1月—2014年5 月于昆明医科大学第一附属医院妇产科门 诊定期产前检查并入院分娩的GDM孕妇3例为病例组，同期健康孕妇3例为对照组。剖宫产术中剥离大网膜下脂肪组 织，提取全基因组DNA。经变性和扩增后酶切扩增产物，将DNA片段与IlluminaMethylationBeadChip芯片进行杂交。 根据MethylationAnalysisAlgorithms 生成各样本每个位点的甲基化水平，经过偏差校正和位点过滤，得到甲基化水平。 采用DAVID数据库对具有显著性差异的甲基化基因进行 GeneOntology （GO）和KyotoEncyclopediaofGenesand Genomes （KEGG）信号通路分析。另分别选取同期GDM孕妇和无GDM孕妇各5例，验证候选基因启动子区域甲基化 水平差异。结果 病例组1298个基因低甲基化，1570个基因高甲基化，其中TMEM195、TCF7L2、IGF1、IGF1R 甲 基化可能与血糖调控密切相关，DGKG、NRXN3 甲基化可能与体质指数（BMI）密切相关。GO功能分析显示，低甲基 化基因参与的生物学过程主要是级联反应的活性调节、细胞凋亡调节及蛋白转运等，细胞成分主要为细胞外基质；高 甲基化基因参与的生物学过程主要是抗原处理和呈递、主要组织相容复合体（MHC） 参与的抗原处理和呈递，细胞 Ⅱ 成分主要为肌动骨架蛋白、MHC等。KEGG信号通路分析中，富集数 ＞20.000 的通路有抗原处理和呈递（富集数为 23.142）、过氧化物酶体增殖物激活受体（PPAR）信号通路（富集数为22.068 ）。分别选取参与抗原处理和呈递、 PPAR信号通路中的甲基化差异基因人类白细胞抗原G （HLAG）、PPARGC1A进行验证。GDM孕妇大网膜下脂肪组织 HLAG启动子区域甲基化水平高于无GDM孕妇（t＝4.968，P＝0.001）。两者大网膜下脂肪组织PPARGC1A启动子区 域甲基化水平比较，差异无统计学意义（t＝0.929，P ＝0.380）。结论 GDM 孕妇和健康孕妇大网膜下脂肪组织基因 甲基化位点和水平存在显著差异，甲基化差异基因主要参与抗原处理和呈递及PPAR信号通路途径。 【关键词】 糖尿病，妊娠 DNA 甲基化；脂肪组织；抗原呈递；过氧化物酶体增殖物激活受体；全基因组关联 研究 【中图分类号】R714.256 【文献标识码】A DOI：10.3969/j.issn.1007 9572.2017.02.008 钱源，孙浩，肖雪，等. 妊娠期糖尿病孕妇大网膜下脂肪组织全基因组 DNA 甲基化研究［J］. 中国全科医学， 2017，20 （2）：159 164. ［］ QIANY，SUNH，XIAOX，etal. WholegenomeDNAmethylationinthevisceralomentaladiposetissueofpatientswith gestationaldiabetesmellitus ［J］. ChineseGeneralPractice，2017，20 （2）：159 164. WholeGenomeDNAMethylationintheVisceralOmentalAdiposeTissueofPatientswithGestationalDiabetesMellitus 1* 2