DNA条形码序列对9种蒿属药用植物的鉴定.PDFVIP

中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 43 卷 第 7 期 2012 年 7 月 • 1393 • DNA 条形码序列对 9 种蒿属药用植物的鉴定 1, 2 1 1 1 2* 1* 刘美子 ，宋经元 ，罗 ，林余霖 ，刘 萍 ，姚 辉 1. 中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所，濒危药材繁育国家工程实验室，北京 100193 2. 天津中医药大学，天津 300193 摘 要：目的 采用DNA 条形码序列对9 种常见的蒿属药用植物进行鉴定，为常见蒿属药用植物的鉴定提供分子依据。方法 对 9 种常见蒿属药用植物的 4 条候选 DNA 条形码序列（ITS2 、rbcL 、matK 、psbA-trnH ）进行 PCR 扩增和测序，比较各序列 的扩增和测序效率，应用BLAST1 、Distance 方法来评估各序列的鉴定效率。此外，基于 MEGA5 分析 9 种常见蒿属药用植 物 ITS2 序列种间 K2P 遗传距离并构建 NJ 树。结果 除 matK 外，其余 3 条片段的 PCR 扩增和测序效率均为 100%，ITS2 序列对9 种蒿属药用植物的物种水平鉴定成功率最高，为 100%，而psbA-trnH 、rbcL 、matK 、matK ＋rbcL 的鉴定成功率（BLAST1 法）分别为 83.3%、66.7%、54.5%、75% 。通过 ITS2 序列的种间 K2P 遗传距离及 NJ 树均能将不同物种全部区分。结论 ITS2 序列可以作为鉴定蒿属药用植物的潜在条形码。 关键词：蒿属；DNA 条形码；ITS2 ；PCR 扩增；遗传距离 中图分类号：R282.12 文献标志码：A 文章编号：0253 - 2670(2012)07 - 1393 - 05 Identification of nine common medicinal plants from Artemisia L. by DNA barcoding sequences 1, 2 1 1 1 2 1 LIU Mei-zi , SONG Jing-yuan , LUO Kun , LIN Yu-lin , LIU Ping , YAO Hui 1. National Engineering Laboratory for Breeding of Endangered Medicinal Materials, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100193, China 2. Tianjin University of Traditional Chinese Medicine, Tianjin 300193, China Abstract: Objective To test DNA barcoding sequences in identification of nine common medicinal plants from Artemisia L. and provide molecular basis for the identification of plants in Artemisia L. Methods The nine species of Artemisia L. were amplified and sequenced using four candidate sequences (ITS2, rbcL, matK, and psbA-trnH ). The PCR amplification and sequencing efficiencies were compared and the identification efficiency was assessed using