计算机重构石油烃降解的微生物代谢途径.pdfVIP

???? 生 技? 术? 通? 讯 ? ????????????????????????????·． ?厶?，??。?．·??～???．?·，?????? ???：??．?????．????．?????????．????．??．???? 研 究 报 告? 计 算 机 重 构 石 油 烃 降解 的微 生 物 代 谢 途径? 王 东? ，何 涛 ’，邵 卫东?，汪莉?，王 玉 民? ?．军事 医学科 学院 生物 工程研 究所 ，北京 ??????；?．苏州大学 电子信息学院 ，江苏 苏州 ??????? ?摘 要 ?? 目 的 ：用 计 算机 重 构 石 油 烃 降解 通 路 ，为 石 油 污 染 的 生物 修 复提 供 理 论 依 据 。方 法 ：利 用 ????反 应 、化 合? 物 数 据 提 取 反 应 等 式 ，过 滤 掉 所 有 反 应 中 的通 用 化 合 物及 小 分 子 化 合 物 并 构 建 反 应 矩 阵 ，然 后 利 用 广 度 优 先 搜 索 算? 法 在 反 应 矩 阵 中搜 索 降解 石 油 烃 的 代 谢 途 径 。 结 果 ：计 算 机 分 别 重构 了???????条 链 烷 烃 降解 途 径 和 ??条 环 己坑 降? 解 途 径 ，以酿 酒 酵 母 作 为 降 解 石 油 烃 的基 因工 程 菌 为例 ，通 过 限制 改构 菌 整 合 的 关键 酶 数 目，分 别 得 到 了???条 不 需? 要 转 入 关 键 酶 的链 烷 烃 降 解通 路和 ?条 以 氧 化 还 原 酶 、松 柏 醇 脱 氢 酶或 环 己醇 脱 氢 酶 和 环 己酮 单 氧 酶 为 关 键 酶 的环? 己烷 降解 通 路 ，并 构 建 相 应 的 降解 网络 图 ，标 注 每 个 反 应 的酶 。结 论 ：应 用 计 算 机 重 构 了?种 石 油 烃 降 解 途 径 ，可 为? 利 用 微 生 物 对 石 油 污 染进 行 生 物修 复提 供 理 论 依 据 。? ?关 键 词 ?? 石 油 污 染