基于对数线性模型的酵母基因转录调控模体分析.pdfVIP

第 ?卷 第 ?期? 生 物?信 息 学? ???．????．?? ???????年 ?月? ???????????????????????????????? ???．。????? ???：??．????／?．????．????— ????．????．??．???? 基 于对 数 线 性模 型 的酵母 基 因转 录 调 控模 体 分 析? 周荣 阁 ，张 静? ?云南大学数学与统计学院统计 系 ，昆明 ???????? 摘? 要 ：识别真核基 因的转录 因子结合位点?或称模体 ?是 后基因组时代 的一项 主要工作 ，对共表达或共调 控的基 因同时进 行? 分析可 以提高模体识别 的准确 性。本文基于 ?×?列联表 的对数 线性模型 ，以模体 出现 的基 因条 数计数 ， 对酵母 核糖体 蛋 白? ????基 因普遍使用 的转录调 控模体进 行分 析 ，然后用 ?一检 验进一 步筛选 出相对 于背景序列来说 过表达 的模体 。这 些模体? 为酵母 ??基 因潜在 的转录调控 元件 ，与实验获得 的转录 因子结合位点 的符合率达 ??％。本方法的优点在于用严格的统计标? 准在一组基 因启动子 中搜 索普遍使用 的模体 ，克服 了以往分 析 中对模 体使用 普遍 性的模糊 判断。本 文 的方法也 可以有效地? 有哪些信誉好的足球投注网站共表达基 因族的组合调控模体对。研究 中还发现一个现象 ：?×?列联表 中反 映属性相关程度 的 ???????相 关系数与对 数? 线性模 型的交互效应之 间存在着 明显 的相关性。这一结果提示 ，可以用对数 线性模 型的交 互效应来评价 两属性 的关联情况