中科院合肥分院浪潮集群使用规范[简要说明].ppt

中国科学院合肥分院;集群的软硬件配置;集群物理拓扑图;Inspur group;一：账号的申请和使用;二：登录、退出系统连接;二：登录、退出系统连接;登陆天梭集群系统 ssh -l (your count) 202.127.207.132 第一次登陆设置环境变量 vi ~/.bashrc source /opt/intel/impi/3.1/bin64/mpivars.sh source /opt/intel/cce/10.1.021/bin/iccvars.sh source /opt/intel/fce/10.1.021/bin/ifortvars.sh source /opt/intel/mkl/10.2.2.025/tools/environment/mklvarsem64t.sh 保存退出后 source ~/.bashrc 使用命令 du -kh | sort -n ，查看异常或较大的文件;三：属主目录使用;四：计算任务投放;PBS基本组件 pbs command:用于提交、监视、修改和删除作业。 pbs server: 提供基本的批处理服务，例如接收/创建一个批处理作业，管理维护作业队列，管理输出结果等。 pbs mom:是一个守护进程，从pbs server处接收作业后放入其执行队列中等待执行。 scheduler(maui): 对用户提交的作业进行调度;Torque应该如何使用? 熟悉Torque提供的几个命令 编写作业提交脚本 了解使用注意事项 PBS命令 qsub 作业提交脚本 qstat [参数] qdel 作业号;PBS命令详解 提交作业的命令 qsub 作业提交脚本 此命令执行后,会给出个作业号 查询作业命令 qstat [参数] 其中参数可为: -q 列出系统队列信息 -Q：列出队列的一些限制信息 -an：列出队列中的所有作业 -r：列出正在运行的作业 -f jobid：列出指定作业在信息 -Qf queue：列出指定队列的所有信息 -B：列出PBS服务器的相关信息;PBS命令详解 作业删除命令 qdel 作业号 其中作业号为qsub提交后系统所给出的一个号码 注意事项 1、非root用户只能查看、删除自己提交的作业 2、在提交作业时一定要根据自己的使用的机器数估算内存，把其写进作业提交脚本里。 3、root用户无法提交作业 4、检查PBS脚本是否正确，任务投放到testque上 ;Inspur group;Inspur group;Inspur group;Inspur group;Inspur group;Inspur group;Inspur group;作业脚本注意事项 为减少资源消耗，系统配置采用autofs，20分钟无操作，即会卸载目录，因此，在脚本中，需使用绝对路径，保证任务可以正常运行 作业脚本参考 VASP Wien2k g03 castep dmol3 espresso;Inspur group;查询作业(2);删除作业;五：存储空间使用;五：存储空间使用;六：软件安装及使用规范;六：软件安装及使用规范;六：软件安装及使用规范;六：软件安装及使用规范;七：关机和启动;八：维护人员联系方式;A;*