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生物化学实验2实验报告
吉林大学国家级生物实验教学示范中心实验报告 姓名:李勍动课程:生物化学实验 = 2 \* ROMAN \* MERGEFORMAT II题目:动物基因组DNA、总RNA的提取及含量测定学号:时间:2012.11.24成绩:教师签字: 共 页,第 页 一、实验目的 1、学习和掌握从动物组织中提取核酸的原理和操作技术; 2、了解提取DNA/RNA的几种方法,原理和优缺点; 3、学习测定DNA/RNA含量的基本原理及具体方法; 4、熟悉离心机、分光光度计等仪器的使用方法。 二、实验原理 (一)背景知识 核酸是遗传信息的携带者,是生命的最基本物质,参与蛋白质合成、基因表达与细胞功能调节。 核酸种类:DNA—线型双链、环状双链、线型单链、环状单链。 RNA—rRNA、tRNA、mRNA。 核酸的分布:细胞核、线粒体、叶绿体、核糖体、游离。 (二)核酸的理化性质 1、粘度 大分子溶液比普通溶液粘度大,线形大分子又比球形大分子粘度大。DNA是线形大分子,人类二倍体DNA总量3.3×109bp,全长可达1.75米,DNA分子平均长度在4cm以上,而双螺旋直径只有2nm,长度与直径之比高达107。因此,DNA粘度极高,也极易在机械力作用下折断。双链DNA解链成为单链DNA时,由较伸展的双螺旋变成较紧凑的线团结构,粘度明显下降。RNA因为分子量小,且呈线团结构,所以其粘度低得多。 2、密度 利用密度梯度离心可以测定大分子的浮力密度。CsCl溶解度大,可制成8M溶液。DNA的浮力密度一般在1.7以上,RNA为1.6,蛋白质为1.35-1.40。分子量相同结构不同的DNA沉降系数不同,线形双螺旋DNA、线形单链DNA、超螺旋DNA沉降系数之比为1:1.14:1.4。因此通过测定沉降系数可以了解DNA的结构及其变化。 3、紫外吸收 嘌呤和嘧啶因其共轭体系而有强紫外吸收。核酸在260nm有紫外吸收峰,蛋白质在280nm。利用紫外吸收可测定核酸的浓度和纯度。一般测定OD260/OD280,DNA=1.8,RNA=2.0。如果含有蛋白质杂质,比值明显下降。不纯的核酸不能用紫外吸收法测定浓度。紫外吸收改变是DNA结构变化的标志,当双链DNA解链时碱基外露增加,紫外吸收明显增加,称为增色效应。双链、单链DNA与核苷酸的紫外吸收之比是1:1.37:1.6。 4、DNA的变性 在一定条件下,双链DNA解链变成单链DNA的现象称为变性或熔化。加热引起的变性称为热变性;碱性条件(pH11.3)下,DNA发生碱变性。此外,尿素、有机溶剂、甚至脱盐都可引起DNA变性。除去变性因素后,互补的单链DNA又可以重新结合为双链DNA,称为复性或退火。DNA复性由局部序列配对形成双链核心的慢速成核反应开始,然后经过快速的所谓拉链反应而完成。 DNA变性后粘度降低,密度和吸光度升高。 (三)核酸分离、纯化原则 在生物体中核酸以结合成核蛋白(DNP/RNP)的形式存在,但核酸极不稳定,在较剧烈的物理、化学因素和酶的作用下都很易降解。核酸的基本分离原则如下: ① 保持核酸分子一级结构的完整性; ② 排除蛋白质、脂类、糖类等其他分子的污染; ③ 无杂核酸分子的污染(如纯化DNA分子时应去除RNA分子)。 注意: = 1 \* GB3 \* MERGEFORMAT ①在低温下进行操作; = 2 \* GB3 \* MERGEFORMAT ②减少物理因素对核酸的机械剪切力; = 3 \* GB3 \* MERGEFORMAT ③防止过酸、过碱引起核酸降解,控制pH值范围(pH值5-9),并要保持一定离子强度; ④防止核酸的生物降解; ⑤细胞内或外来的各种核酸酶能消化核酸链中的磷酸二酯键,破坏核酸一级结构。因此,所用器械和一些试剂需高温灭菌,提取缓冲液中需加核酸酶抑制剂。 ⑥进行核酸分离时最好新鲜生物组织或细胞样品,若不能马上进行提取,应将材料贮存于液氮中或-70℃冰箱中。 (四)RNA的提取 RNA广泛存在啤酒酵母,面包酵母,酒精酵母和各种动物组织中。 常见方法(依据RNA的种类和来源):①苯酚法(实验室最常用的方法)②去污剂法③盐酸胍法 实验室提取RNA的方法 (1)苯酚法:组织匀浆后用苯酚处理离心,RNA即溶于上层被苯酚饱和的水相中, DNA和蛋白质则留在苯酚层中,向水相加冷乙醇后, RNA即以白色絮状沉淀析出。 优点:较好除去DNA和蛋白质,且获得生物活性的RNA。 (2)本实验提取RNA的原理及方法 原理:动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白(DNP)可溶于水或浓盐溶液(如1mol/L氯化钠),但在0.14mol/L氯化钠盐溶液中溶解度最低,而核酸核蛋白
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