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核酸的結构ppt
第二节
核酸的结构;一、核酸的一级结构;5′端;A ;核酸一级结构书写规则;二、DNA的二级结构-双螺旋结构;(一)DNA双螺旋结构的研究背景;Chargaff规则:
(1)A=T
(2)G=C
(3)A+C=G+T
(4)A+G=C+T;(二) DNA双螺旋结构模型要点
(Watson, Crick, 1953);(二) DNA双螺旋结构模型要点 ;碱基互补配对 ;碱基平面与纵轴垂直,糖环平面与纵轴平行;(二) DNA双螺旋结构模型要点
(Watson, Crick, 1953);DNA,双螺旋,正反向,互补链。
A对T,GC连,配对时,用氢键(AT2,GC3)
十碱基,转一圈,螺距34点中间。
碱基力和氢键,维持螺旋结构坚。
PS:
AT2,GC3:指AT之间二个氢键,GC间三个.
螺距34点中间即3.4。;①碱基堆积力形成疏水环境(主要因素) 。
②碱基配对的氢键。GC含量越多,越稳定。
③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键,中和了磷酸基上的负电荷间的斥力,有助于DNA稳定。
④碱基处于双螺旋内部的疏水环境中,可免受水溶性活性小分子的攻击。;
类型 结晶状态 螺距 碱基距离 每圈 旋转
(nm) (nm) bp数 方向
A 相对湿度75% 2.3 0.255 11 右手
DNA钠盐
B 相对湿度92% 3.4 0.34 10 右手
DNA钠盐
C 相对湿度66% 3.1 0.332 9.3 右手
DNA锂盐
Z d(GCGCGC) 4.5 0.37 12 左手; DNA双螺旋结构的多样性;DNA双螺旋结构的多样性;DNA的其他结构类型; (一)定义
DNA双螺旋通过扭曲和折叠所形成的特定构象。
包括:
不同二级结构单元间的相互作用
单链与二级结构单元间的相互作用
DNA的拓扑特征
超螺旋是DNA三级结构的主要形式。;超螺旋结构(supercoil)
DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。
超螺旋DNA结构致密,增加了其稳定性。;意义
DNA超螺旋结构整体或局部的拓扑学变化及其调控对于DNA复制和RNA转录过程具有关键作用。 ;(二)环状DNA的三种典型构象;①连环数(linking number , L)
DNA双螺旋中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数
②扭转数(twisting number , T)
DNA分子中的Watson-Crick螺旋数目,以T表示
③???螺旋数(缠绕数 , writhing number , W);(三)拓扑异构酶
改变DNA拓扑异构体的L值。
①拓扑异构酶酶I(解旋酶)
能使双链负超螺旋DNA转变成松驰形环状DNA,每次催化使L值增加1。
②拓扑异构酶酶II(促旋酶)
能使松驰环状DNA转变成负超螺旋形DNA,每次催化使L减少2。;核小体由DNA链连在一起形成念珠状结构;DNA的存在形式;核小体的组成及性质;串珠状核小体结构;染色体的形成;串珠状核小体;2、序列特异性DNA结合蛋白(SDBP);DNA的功能;第五节 DNA和基因组;二、病毒和细菌基因组的特点;2. 病毒基因组的特点;3)重叠基因
一段可以编码多个肽链的核酸序列
重叠基因普遍存在,超过基因总量的10%;3. 细菌基因组的特点;三、真核生物基因组特点;3. 存在大量的重复序列
;4. 有断裂基因;第六节 RNA的结构与功能;1. 碱基组成 A、G、C、U (A=U/G≡C) 稀有碱基较多,稳定性较差,易水解
多为单链结构; 少数局部自身回折形成双螺旋(40%~70%), 不能配对的碱基形成突环
分子较小;RNA通常是单链线形分子(一级结构)
2. 自身回折形成局部双螺旋(二级结构)
3. 进而折叠(三级结构)
4.多数形成核蛋白复合物(四级结构)
如:核糖体、拼接体、编辑体等。 ;核糖核苷酸通过
3,,5,-磷酸二酯键相连形成长链;RNA的种类、分布、功能; 一、转运RNA的结构与功能;由70~90个核苷酸组成
含 10~20% 稀有碱基
3′末端为 — CCA-OH
5′末端大多数为G
具有 T?C ; 稀有碱基 ; (二)tRNA的二级结构—三叶草型模型;①氨基酸臂:由7对b
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