2014-04-15承担单位福建省农科院农业生物资源研究所试验设计.doc

PAGE 2014-04-15 承担单位：福建省农科院农业生物资源研究所 试验设计： 试验项目：青海土壤中分离的22株芽胞杆菌的16S rRNA测序鉴定 试验人员：林玉春 试验负责：车建美 报告日期：2014-04-15 计数月份：2014年04月 研究资格系数 (0.5-1.0) 实验设计系数 （0.9-1.0） 报告得分 总分 实验设计 实验记载 实验分析 实验简报 实验文章 1-20% 21-40% 41-60% 61-80% 81-100% 1%-5% 设计不足，实施错误 6%-10% 设计不全，实验无果 11%-15% 设计可以，实施不全 16%-20% 设计完整，分布实施 21%-25% 实验不全，记载无果 26%-30% 实验不足，记载不全 31%-35% 独立实验，记载不全 36%-40% 分布实验，记载完整 41%-45% 目的明确，实验完成 46%-50% 实验完整，记载清晰 51%-55% 实验系统，结果可信 56%-60% 实验创新，分析清晰 61%-65% 实验创新，结论清晰 66%-70% 实验完整，统计清晰 71%-75% 实验系统，数据可靠 76%-80% 报告完整，文章雏形 81%-85% 结构合理，分析有据 86%-90% 逻辑清晰，统计合理 91%-95% 图表完整，写作流畅 96%-100% 文献完整，发表水平 福建省农业科学院农业生物资源研究所 微生物研究中心 电话: 0591 传真: 0591 HYPERLINK 试验目的 芽胞杆菌是一种能产生对热、紫外线、电磁辐射和某些化学药品具有强抗性的芽胞，能够在多种不良环境下存活，分化形成具有特殊功能的菌株，在生产实践中被广泛应用[1]。土壤是微生物生活的大本营，存在着各种各类的微生物。芽胞杆菌在农业、工业、医学等领域有着重要的作用，而土壤中含有大量的芽胞杆菌。从土壤中分离芽胞杆菌，对芽胞杆菌资源的利用和分类工作有非常重要的作用。 近年来，RAPD、AFLP、RFLP以rDNA等分子生物学技术在细菌、真菌的分类及鉴定中应用逐渐增多[2-6]。16S rRNA作为蛋白质合成的必要场所，存在于所有原核生物的细胞中并执行相同的功能，由于该蛋白分子序列变化缓慢，能够跨越整个生命进化过程，而且它的分子中含有进化速度不同的区域，可用于进化程度不同的生物之间的系统发育研究[7]，因此，目前该技术在原核生物的鉴定中应用非常广泛。 本实验通过提取芽胞杆菌总DNA，利用细菌16S rRNA通用引物，鉴定了从青海采集的土壤中分离得到的22株芽胞杆菌，并进行测序及序列比对分析，以确定所分离的菌株的分类地位。 2．试验方法 2.1材料与仪器 2.1.1供试菌株 从青海土壤中分离得到的22株芽胞杆菌菌株，具体信息见 REF _Ref338965594 \h 表 1。 表 SEQ 表 \* ARABIC 1 供试菌株信息 Table SEQ Table \* ARABIC 1 The information of the tested strains 序号 菌株编号 分离来源 生境类型 1. FJAT-18445 未编 青海互助北山羊山土 2. FJAT-18446 未编 青海互助北山羊山土 3. FJAT-18447 未编 青海互助北山羊山土 4. FJAT-18448 未编 青海互助北山羊山土 5. FJAT-18449 未编 青海互助北山断层干土下层土 6. FJAT-18450 未编 青海互助北山断层干土下层土 7. FJAT-18452 未编 青海互助北山断层干土下层土 8. FJAT-18453 未编 青海互助北山断层干土下层土 9. FJAT-18454 未编 青海互助北山断层干土中间层 10. FJAT-18455 未编 青海互助北山断层干土中间层 11. FJAT-18456 未编 青海互助北山断层干土中间层 12. FJAT-18457 未编 青海互助北山断层干土中间层 13. FJAT-18458 未编 青海互助北山断层干土中间层 14. FJAT-18459 未编 青海互助北山断层干土中间层 15. FJAT-18460 未编 青海互助北山断层干土中间层 16. FJAT-18461 未编 青海互助北山断层干土中间层 17. FJAT-18462 未编 青海互助北山断层干土中间层 18. FJAT-18478 未编 青海互助北山公路旁苔藓土 19. FJAT-18486 未编 青海互助北山松树林菇土壤 20. FJAT-18492 未编 青海互助北山松树林菇土壤 21. FJAT-18508 未编 青海互助北山菇土壤 22. FJAT-18615 未编 青海省互助北山睡佛半山断层土 2