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Lammps软件的学习和应用选编
Lammps 软件的学习和应用;主要内容 分享一些曾经的学习和使用体会;Lammps程序初识;Lammps程序 能与不能;Lammps程序目前的特点(简述);Lammps程序入门 选择正确的比正确的选择更重要;Lammps手册的使用----法宝;Lammps程序的应用 千里之行,始于足下;实例研读一之裂纹分析;# define groups
#-----------------------过程建模--------------------
Region 1 block INF INF INF 1.25 INF INF //区域划分
group lower region 1 //区域内原子分组
region 2 block INF INF 38.75 INF INF INF
group upper region 2
group boundary union lower upper
group mobile subtract all boundary //组原子可以组合
region leftupper block INF 20 20 INF INF INF
region leftlower block INF 20 INF 20 INF INF
group leftupper region leftupper
group leftlower region leftlower
set group leftupper type 2 // 不同区域原子分配类型
set group leftlower type 3
set group lower type 4
set group upper type 5;# initial velocities
#---------------过程建模-----------------
compute new mobile temp
velocity mobile create 0.01 887723 temp new //边界施加速度
velocity upper set 0.0 0.3 0.0
velocity mobile ramp vy 0.0 0.3 y 1.25 38.75 sum yes
#----------------分子动力学过程建模---------
# fixes
fix 1 all nve //积分,样本
fix 2 boundary setforce NULL 0.0 0.0
# run
#------------------输出建模-------------------
timestep 0.003 //时间步长
thermo 200 //采样步长
thermo_modify temp new
neigh_modify exclude type 2 3
dump 1 all atom 500 dump.crack //输出到文件
run 5000 //运行开始;Lammps程序应用之二----表面能计算;100表面表面能计算;过程建模:实现真空层;过程建模:移动盒子,移动原子,产生新的表面,计算产生新表面后的E(final);Lammps具有强大功能和开放式的扩充结构
后续的数据处理常常是非常辛苦的
Lammps程序需要结合其他程序来完成你的发文章的要求模拟研究的任务。
做好修改源程序的准备
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